30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2209 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2209  lycopene cyclase  100 
 
 		 384 aa  763    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1713  lycopene cyclase  44.53 
 
 		 395 aa  265  8.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0564818  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3576  lycopene cyclase  41.89 
 
 		 385 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1817  lycopene cyclase  42.29 
 
 		 398 aa  234  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3135  lycopene cyclase  40.57 
 
 		 385 aa  209  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3200  lycopene cyclase  33.62 
 
 		 380 aa  166  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696424  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  26.33 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0926  lycopene beta and epsilon cyclase  22.68 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0447  Lycopene beta and epsilon cyclase  22.44 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5144  lycopene cyclase family protein  29.73 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0382  Lycopene beta and epsilon cyclase  28.85 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00930  putative lycopene cyclase  21.38 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2394  lycopene cyclase family protein  25.95 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.990938  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06951  putative lycopene epsilon cyclase  24.08 
 
 		 428 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02164  hypothetical protein  24.19 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3088  putative lycopene cyclase  30.28 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1563  Lycopene beta and epsilon cyclase  27.21 
 
 		 391 aa  53.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1941  lycopene cyclase (CrtL-type)  24.73 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4955  Lycopene beta and epsilon cyclase  23.02 
 
 		 388 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127751  normal  0.0780528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2643  lycopene cyclase family protein  24.32 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11541  putative lycopene beta cyclase  21.91 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0749733  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0073  lycopene cyclase (CrtL-type)  22.71 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2557  lycopene beta and epsilon cyclase  28.99 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329611  decreased coverage  0.00000286937 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07411  putative lycopene epsilon cyclase  21.98 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0418129  normal  0.37911 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  20.69 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11691  putative lycopene beta cyclase  19.2 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.451912  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0091  Lycopene beta and epsilon cyclase  32.86 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.457408  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0857  lycopene cyclase, beta and epsilon  27.17 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.27031 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1075  lycopene cyclase (CrtL-type)  20.17 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5914  lycopene cyclase family protein  28.27 
 
 		 399 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>