22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2557 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2408  lycopene beta and epsilon cyclase  91.42 
 
 		 419 aa  665    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2557  lycopene beta and epsilon cyclase  100 
 
 		 416 aa  797    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329611  decreased coverage  0.00000286937 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3088  putative lycopene cyclase  45.36 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3568  Lycopene beta and epsilon cyclase  45.34 
 
 		 410 aa  239  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1563  Lycopene beta and epsilon cyclase  38.38 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0091  Lycopene beta and epsilon cyclase  46.09 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.457408  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1488  Lycopene beta and epsilon cyclase  37.89 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000548703 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0382  Lycopene beta and epsilon cyclase  37.43 
 
 		 397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0447  Lycopene beta and epsilon cyclase  32.2 
 
 		 393 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00930  putative lycopene cyclase  27.76 
 
 		 383 aa  189  7e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0926  lycopene beta and epsilon cyclase  26.42 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294994  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  31.98 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4955  Lycopene beta and epsilon cyclase  26.88 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127751  normal  0.0780528 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02164  hypothetical protein  25.7 
 
 		 385 aa  106  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3060  lycopene beta and epsilon cyclase  27.75 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5914  lycopene cyclase family protein  30.35 
 
 		 399 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1713  lycopene cyclase  27.08 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0564818  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  27.5 
 
 		 528 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2062  lycopene cyclase (CrtL-type)  22.59 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0950  lycopene cyclase family protein  28.57 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.75613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2209  lycopene cyclase  30.2 
 
 		 384 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2711  lycopene cyclase family protein  26.02 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>