22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0926 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0926  lycopene beta and epsilon cyclase  100 
 
 		 389 aa  797    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294994  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0382  Lycopene beta and epsilon cyclase  39.74 
 
 		 397 aa  290  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1563  Lycopene beta and epsilon cyclase  38.12 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00930  putative lycopene cyclase  36.72 
 
 		 383 aa  260  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0447  Lycopene beta and epsilon cyclase  34.94 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1488  Lycopene beta and epsilon cyclase  39.52 
 
 		 388 aa  255  8e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000548703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3568  Lycopene beta and epsilon cyclase  31.94 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4955  Lycopene beta and epsilon cyclase  28.53 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127751  normal  0.0780528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2408  lycopene beta and epsilon cyclase  27.79 
 
 		 419 aa  169  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2557  lycopene beta and epsilon cyclase  27.79 
 
 		 416 aa  152  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329611  decreased coverage  0.00000286937 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3088  putative lycopene cyclase  27.37 
 
 		 393 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0091  Lycopene beta and epsilon cyclase  27.99 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.457408  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  25 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02164  hypothetical protein  23.83 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3060  lycopene beta and epsilon cyclase  25.57 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1713  lycopene cyclase  19 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0564818  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3135  lycopene cyclase  25.61 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1817  lycopene cyclase  24.58 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2209  lycopene cyclase  22.04 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3576  lycopene cyclase  20.8 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  25.14 
 
 		 442 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  24.76 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>