26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0382 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0382  Lycopene beta and epsilon cyclase  100 
 
 		 397 aa  811    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1488  Lycopene beta and epsilon cyclase  59.95 
 
 		 388 aa  464  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000548703 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1563  Lycopene beta and epsilon cyclase  58.42 
 
 		 391 aa  467  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0447  Lycopene beta and epsilon cyclase  41.75 
 
 		 393 aa  323  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0926  lycopene beta and epsilon cyclase  39.74 
 
 		 389 aa  279  6e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294994  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00930  putative lycopene cyclase  34.4 
 
 		 383 aa  257  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0157351  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3088  putative lycopene cyclase  43.94 
 
 		 393 aa  237  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4955  Lycopene beta and epsilon cyclase  34.24 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127751  normal  0.0780528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3568  Lycopene beta and epsilon cyclase  38.29 
 
 		 410 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2408  lycopene beta and epsilon cyclase  37.88 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2557  lycopene beta and epsilon cyclase  37.06 
 
 		 416 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329611  decreased coverage  0.00000286937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0091  Lycopene beta and epsilon cyclase  37.43 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.457408  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  30.77 
 
 		 417 aa  149  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02164  hypothetical protein  28.17 
 
 		 385 aa  146  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3060  lycopene beta and epsilon cyclase  26.93 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3576  lycopene cyclase  28.9 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2209  lycopene cyclase  28.85 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  25.07 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1713  lycopene cyclase  24.83 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0564818  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11261  putative lycopene beta cyclase  23.23 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2458  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50 
 
 		 554 aa  46.6  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.144677  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0688  lycopene cyclase (CrtL-type)  22.71 
 
 		 414 aa  46.6  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.103999  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15221  putative lycopene beta cyclase  22.98 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3144  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.76 
 
 		 521 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  38.89 
 
 		 541 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3135  lycopene cyclase  26.7 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>