21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1488 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1488  Lycopene beta and epsilon cyclase  100 
 
 		 388 aa  801    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000548703 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0382  Lycopene beta and epsilon cyclase  59.95 
 
 		 397 aa  464  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1563  Lycopene beta and epsilon cyclase  52.63 
 
 		 391 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0447  Lycopene beta and epsilon cyclase  41.65 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0926  lycopene beta and epsilon cyclase  39.25 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294994  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00930  putative lycopene cyclase  36.39 
 
 		 383 aa  246  4.9999999999999997e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4955  Lycopene beta and epsilon cyclase  35.77 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127751  normal  0.0780528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3088  putative lycopene cyclase  37.76 
 
 		 393 aa  213  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2408  lycopene beta and epsilon cyclase  38.9 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2557  lycopene beta and epsilon cyclase  37.5 
 
 		 416 aa  203  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329611  decreased coverage  0.00000286937 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3568  Lycopene beta and epsilon cyclase  36.95 
 
 		 410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0091  Lycopene beta and epsilon cyclase  38.86 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.457408  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  33.15 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02164  hypothetical protein  27.69 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3060  lycopene beta and epsilon cyclase  29.35 
 
 		 401 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15221  putative lycopene beta cyclase  22.68 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0688  lycopene cyclase (CrtL-type)  22.36 
 
 		 414 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.103999  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  23.61 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3135  lycopene cyclase  25.14 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2062  lycopene cyclase (CrtL-type)  24.61 
 
 		 411 aa  43.5  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>