34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0688 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0688  lycopene cyclase (CrtL-type)  100 
 
 		 414 aa  858    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.103999  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15221  putative lycopene beta cyclase  99.27 
 
 		 414 aa  849    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11261  putative lycopene beta cyclase  65.59 
 
 		 407 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09161  putative lycopene beta cyclase  62.09 
 
 		 408 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11541  putative lycopene beta cyclase  60.55 
 
 		 403 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0749733  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1075  lycopene cyclase (CrtL-type)  58.85 
 
 		 403 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11691  putative lycopene beta cyclase  58.35 
 
 		 403 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.451912  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  58.1 
 
 		 403 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1941  lycopene cyclase (CrtL-type)  56.17 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0724  lycopene cyclase, beta and epsilon  56.22 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2062  lycopene cyclase (CrtL-type)  50 
 
 		 411 aa  422  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0633  lycopene cyclase (CrtL-type)  48.56 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06891  putative lycopene epsilon cyclase  48.18 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.895812  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06601  putative lycopene epsilon cyclase  48.09 
 
 		 427 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07411  putative lycopene epsilon cyclase  49.14 
 
 		 427 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0418129  normal  0.37911 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06991  putative lycopene epsilon cyclase  47.68 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.28746  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0073  lycopene cyclase (CrtL-type)  47.82 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06951  putative lycopene epsilon cyclase  47.33 
 
 		 428 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23511  putative lycopene epsilon cyclase  50.37 
 
 		 426 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2643  lycopene cyclase family protein  45.82 
 
 		 413 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2711  lycopene cyclase family protein  44.72 
 
 		 413 aa  345  7e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  28.98 
 
 		 528 aa  194  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0857  lycopene cyclase, beta and epsilon  35.26 
 
 		 435 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.27031 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  32.05 
 
 		 442 aa  188  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56484  precursor of cyclase lycopene beta cyclase  29.86 
 
 		 659 aa  186  7e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00169655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5914  lycopene cyclase family protein  31.23 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0950  lycopene cyclase family protein  29.85 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.75613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2394  lycopene cyclase family protein  30.19 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.990938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5144  lycopene cyclase family protein  28.49 
 
 		 359 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2495  Lycopene beta and epsilon cyclase  26.3 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  26.07 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3576  lycopene cyclase  24.11 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1488  Lycopene beta and epsilon cyclase  22.36 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000548703 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0382  Lycopene beta and epsilon cyclase  22.71 
 
 		 397 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>