32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2495 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2495  Lycopene beta and epsilon cyclase  100 
 
 		 351 aa  677    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2394  lycopene cyclase family protein  43.39 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.990938  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0950  lycopene cyclase family protein  38.46 
 
 		 401 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.75613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5914  lycopene cyclase family protein  39.59 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5144  lycopene cyclase family protein  35.82 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2643  lycopene cyclase family protein  31.23 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0857  lycopene cyclase, beta and epsilon  33.68 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.27031 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11541  putative lycopene beta cyclase  25.13 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0749733  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2711  lycopene cyclase family protein  31.99 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2062  lycopene cyclase (CrtL-type)  28.86 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  25.83 
 
 		 528 aa  98.6  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09161  putative lycopene beta cyclase  27.78 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11691  putative lycopene beta cyclase  24.44 
 
 		 403 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.451912  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15221  putative lycopene beta cyclase  25.38 
 
 		 414 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0688  lycopene cyclase (CrtL-type)  25.63 
 
 		 414 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.103999  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1075  lycopene cyclase (CrtL-type)  24.06 
 
 		 403 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  23.37 
 
 		 403 aa  92.4  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11261  putative lycopene beta cyclase  27.79 
 
 		 407 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06891  putative lycopene epsilon cyclase  23.95 
 
 		 422 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.895812  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06601  putative lycopene epsilon cyclase  23.95 
 
 		 427 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0633  lycopene cyclase (CrtL-type)  23.82 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1941  lycopene cyclase (CrtL-type)  28.64 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06991  putative lycopene epsilon cyclase  23.19 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.28746  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23511  putative lycopene epsilon cyclase  27.43 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0073  lycopene cyclase (CrtL-type)  23.76 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06951  putative lycopene epsilon cyclase  24.01 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07411  putative lycopene epsilon cyclase  26.12 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0418129  normal  0.37911 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  25.96 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0724  lycopene cyclase, beta and epsilon  28.21 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56484  precursor of cyclase lycopene beta cyclase  28.28 
 
 		 659 aa  49.7  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00169655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  27.57 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3448  putative oxidoreductase  31.96 
 
 		 475 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0584145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>