37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2062 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2062  lycopene cyclase (CrtL-type)  100 
 
 		 411 aa  848    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1941  lycopene cyclase (CrtL-type)  56.14 
 
 		 412 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06951  putative lycopene epsilon cyclase  52.52 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0073  lycopene cyclase (CrtL-type)  52.28 
 
 		 428 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06991  putative lycopene epsilon cyclase  49.4 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.28746  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07411  putative lycopene epsilon cyclase  50.36 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0418129  normal  0.37911 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23511  putative lycopene epsilon cyclase  54.22 
 
 		 426 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2643  lycopene cyclase family protein  52.83 
 
 		 413 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06891  putative lycopene epsilon cyclase  48.45 
 
 		 422 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.895812  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11541  putative lycopene beta cyclase  50.75 
 
 		 403 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0749733  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0633  lycopene cyclase (CrtL-type)  49.4 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06601  putative lycopene epsilon cyclase  48.45 
 
 		 427 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09161  putative lycopene beta cyclase  51.88 
 
 		 408 aa  428  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0688  lycopene cyclase (CrtL-type)  50 
 
 		 414 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.103999  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15221  putative lycopene beta cyclase  50.25 
 
 		 414 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0724  lycopene cyclase, beta and epsilon  54.89 
 
 		 407 aa  421  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1075  lycopene cyclase (CrtL-type)  50 
 
 		 403 aa  411  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11261  putative lycopene beta cyclase  50.13 
 
 		 407 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11691  putative lycopene beta cyclase  49.5 
 
 		 403 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.451912  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  50 
 
 		 403 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2711  lycopene cyclase family protein  50.62 
 
 		 413 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  32.3 
 
 		 528 aa  236  6e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  36.14 
 
 		 442 aa  229  7e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0857  lycopene cyclase, beta and epsilon  39.18 
 
 		 435 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.27031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0950  lycopene cyclase family protein  34.26 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.75613 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56484  precursor of cyclase lycopene beta cyclase  30.05 
 
 		 659 aa  177  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00169655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5914  lycopene cyclase family protein  32.79 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2394  lycopene cyclase family protein  30.92 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.990938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5144  lycopene cyclase family protein  31.58 
 
 		 359 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2495  Lycopene beta and epsilon cyclase  30.94 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  25.65 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3576  lycopene cyclase  26.42 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  28.3 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1488  Lycopene beta and epsilon cyclase  24.61 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000548703 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  28.48 
 
 		 379 aa  43.5  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  30.18 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>