33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_11261 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_11261  putative lycopene beta cyclase  100 
 
 		 407 aa  835    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09161  putative lycopene beta cyclase  71.14 
 
 		 408 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0688  lycopene cyclase (CrtL-type)  65.59 
 
 		 414 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.103999  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15221  putative lycopene beta cyclase  65.59 
 
 		 414 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11541  putative lycopene beta cyclase  59.4 
 
 		 403 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0749733  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  60.15 
 
 		 403 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11691  putative lycopene beta cyclase  60.4 
 
 		 403 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.451912  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1075  lycopene cyclase (CrtL-type)  60.15 
 
 		 403 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1941  lycopene cyclase (CrtL-type)  58.19 
 
 		 412 aa  484  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0724  lycopene cyclase, beta and epsilon  58.96 
 
 		 407 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2062  lycopene cyclase (CrtL-type)  50.13 
 
 		 411 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0073  lycopene cyclase (CrtL-type)  50.74 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07411  putative lycopene epsilon cyclase  50.62 
 
 		 427 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0418129  normal  0.37911 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0633  lycopene cyclase (CrtL-type)  50.37 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06601  putative lycopene epsilon cyclase  49.63 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06951  putative lycopene epsilon cyclase  50.25 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06891  putative lycopene epsilon cyclase  49.38 
 
 		 422 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.895812  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06991  putative lycopene epsilon cyclase  49.38 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.28746  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23511  putative lycopene epsilon cyclase  50 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2643  lycopene cyclase family protein  46.21 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2711  lycopene cyclase family protein  44.42 
 
 		 413 aa  345  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0857  lycopene cyclase, beta and epsilon  36.73 
 
 		 435 aa  202  9e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.27031 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56484  precursor of cyclase lycopene beta cyclase  32.47 
 
 		 659 aa  194  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00169655  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  31.96 
 
 		 528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  30.08 
 
 		 442 aa  189  8e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0950  lycopene cyclase family protein  32.9 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.75613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5914  lycopene cyclase family protein  31.45 
 
 		 399 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2394  lycopene cyclase family protein  31.75 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.990938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5144  lycopene cyclase family protein  28.84 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2495  Lycopene beta and epsilon cyclase  30 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0382  Lycopene beta and epsilon cyclase  24.12 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1817  lycopene cyclase  28.87 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  22.07 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>