33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_23511 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_23511  putative lycopene epsilon cyclase  100 
 
 		 426 aa  870    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07411  putative lycopene epsilon cyclase  64.78 
 
 		 427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0418129  normal  0.37911 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06951  putative lycopene epsilon cyclase  64.22 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0073  lycopene cyclase (CrtL-type)  63.51 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0633  lycopene cyclase (CrtL-type)  60.43 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06601  putative lycopene epsilon cyclase  60.43 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06891  putative lycopene epsilon cyclase  60.77 
 
 		 422 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.895812  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06991  putative lycopene epsilon cyclase  58.63 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.28746  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2062  lycopene cyclase (CrtL-type)  54.22 
 
 		 411 aa  457  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1941  lycopene cyclase (CrtL-type)  54.84 
 
 		 412 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09161  putative lycopene beta cyclase  51.98 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0688  lycopene cyclase (CrtL-type)  50.37 
 
 		 414 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.103999  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0724  lycopene cyclase, beta and epsilon  54.07 
 
 		 407 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15221  putative lycopene beta cyclase  50.12 
 
 		 414 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11261  putative lycopene beta cyclase  50 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  45.45 
 
 		 403 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11541  putative lycopene beta cyclase  45.45 
 
 		 403 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0749733  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11691  putative lycopene beta cyclase  45.21 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.451912  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1075  lycopene cyclase (CrtL-type)  45.45 
 
 		 403 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2643  lycopene cyclase family protein  48.92 
 
 		 413 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2711  lycopene cyclase family protein  48.81 
 
 		 413 aa  362  8e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  34.74 
 
 		 442 aa  207  4e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0857  lycopene cyclase, beta and epsilon  36.84 
 
 		 435 aa  192  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.27031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0950  lycopene cyclase family protein  34.72 
 
 		 401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.75613 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  30.53 
 
 		 528 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56484  precursor of cyclase lycopene beta cyclase  32.62 
 
 		 659 aa  176  8e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00169655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5914  lycopene cyclase family protein  34.31 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5144  lycopene cyclase family protein  32.54 
 
 		 359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2394  lycopene cyclase family protein  30.35 
 
 		 374 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.990938  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2495  Lycopene beta and epsilon cyclase  27.18 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  24.35 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3576  lycopene cyclase  25.1 
 
 		 385 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  27.37 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>