40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43511 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  100 
 
 		 442 aa  910    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  35.07 
 
 		 528 aa  258  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2062  lycopene cyclase (CrtL-type)  36.14 
 
 		 411 aa  229  7e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0633  lycopene cyclase (CrtL-type)  33.1 
 
 		 427 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09161  putative lycopene beta cyclase  33.17 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0073  lycopene cyclase (CrtL-type)  34.88 
 
 		 428 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06951  putative lycopene epsilon cyclase  35.12 
 
 		 428 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06891  putative lycopene epsilon cyclase  31.01 
 
 		 422 aa  203  6e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.895812  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06601  putative lycopene epsilon cyclase  31.49 
 
 		 427 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11541  putative lycopene beta cyclase  32.99 
 
 		 403 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0749733  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  34.26 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06991  putative lycopene epsilon cyclase  31.43 
 
 		 427 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.28746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2643  lycopene cyclase family protein  34.31 
 
 		 413 aa  196  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1941  lycopene cyclase (CrtL-type)  33.57 
 
 		 412 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11691  putative lycopene beta cyclase  31.63 
 
 		 403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.451912  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15221  putative lycopene beta cyclase  32.21 
 
 		 414 aa  190  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0688  lycopene cyclase (CrtL-type)  32.05 
 
 		 414 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.103999  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1075  lycopene cyclase (CrtL-type)  32.49 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23511  putative lycopene epsilon cyclase  34.74 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07411  putative lycopene epsilon cyclase  31.99 
 
 		 427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0418129  normal  0.37911 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11261  putative lycopene beta cyclase  30.08 
 
 		 407 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2711  lycopene cyclase family protein  34.31 
 
 		 413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0724  lycopene cyclase, beta and epsilon  32.7 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56484  precursor of cyclase lycopene beta cyclase  30.48 
 
 		 659 aa  162  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00169655  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0857  lycopene cyclase, beta and epsilon  32.23 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.27031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0950  lycopene cyclase family protein  31.53 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.75613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5914  lycopene cyclase family protein  31.64 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2394  lycopene cyclase family protein  27.85 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.990938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5144  lycopene cyclase family protein  33.95 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0382  Lycopene beta and epsilon cyclase  25.07 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2495  Lycopene beta and epsilon cyclase  27.85 
 
 		 351 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3576  lycopene cyclase  28.75 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  33.33 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3088  putative lycopene cyclase  23.94 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0926  lycopene beta and epsilon cyclase  25.14 
 
 		 389 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294994  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  22.63 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3568  Lycopene beta and epsilon cyclase  25.42 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1488  Lycopene beta and epsilon cyclase  23.61 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000548703 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  25.59 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0059  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  55.26 
 
 		 507 aa  43.5  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.492285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>