30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3576 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3576  lycopene cyclase  100 
 
 		 385 aa  771    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1713  lycopene cyclase  51.96 
 
 		 395 aa  348  8e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0564818  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3135  lycopene cyclase  49.2 
 
 		 385 aa  311  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1817  lycopene cyclase  47.37 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2209  lycopene cyclase  41.89 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3200  lycopene cyclase  40.35 
 
 		 380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696424  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02164  hypothetical protein  24.42 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0382  Lycopene beta and epsilon cyclase  28.9 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2062  lycopene cyclase (CrtL-type)  26.87 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  25.94 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2394  lycopene cyclase family protein  25.8 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.990938  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0447  Lycopene beta and epsilon cyclase  22.36 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11691  putative lycopene beta cyclase  25.19 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.451912  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1941  lycopene cyclase (CrtL-type)  25.83 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15221  putative lycopene beta cyclase  24.11 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0688  lycopene cyclase (CrtL-type)  24.11 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.103999  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  24.44 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  25.75 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0091  Lycopene beta and epsilon cyclase  29.72 
 
 		 382 aa  49.7  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.457408  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0926  lycopene beta and epsilon cyclase  20.38 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294994  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23511  putative lycopene epsilon cyclase  25.86 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1075  lycopene cyclase (CrtL-type)  25.58 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2643  lycopene cyclase family protein  27.65 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  25.48 
 
 		 528 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11541  putative lycopene beta cyclase  25.75 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0749733  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5144  lycopene cyclase family protein  29.48 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0950  lycopene cyclase family protein  29.44 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.75613 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06951  putative lycopene epsilon cyclase  22.27 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5914  lycopene cyclase family protein  31.45 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1563  Lycopene beta and epsilon cyclase  32.56 
 
 		 391 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>