22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3135 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3135  lycopene cyclase  100 
 
 		 385 aa  768    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1817  lycopene cyclase  52.23 
 
 		 398 aa  328  8e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3576  lycopene cyclase  49.87 
 
 		 385 aa  328  9e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1713  lycopene cyclase  44.09 
 
 		 395 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0564818  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2209  lycopene cyclase  42.28 
 
 		 384 aa  229  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3200  lycopene cyclase  37.18 
 
 		 380 aa  215  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696424  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  28.36 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0447  Lycopene beta and epsilon cyclase  25.38 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02164  hypothetical protein  23 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0926  lycopene beta and epsilon cyclase  21.67 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294994  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2394  lycopene cyclase family protein  25 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.990938  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  26.5 
 
 		 528 aa  53.1  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00930  putative lycopene cyclase  18.98 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0157351  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3088  putative lycopene cyclase  27.3 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1563  Lycopene beta and epsilon cyclase  26.02 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11691  putative lycopene beta cyclase  21.03 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.451912  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  24.23 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  23.38 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1488  Lycopene beta and epsilon cyclase  25.14 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000548703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2408  lycopene beta and epsilon cyclase  26.24 
 
 		 419 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0382  Lycopene beta and epsilon cyclase  26.7 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1075  lycopene cyclase (CrtL-type)  25.6 
 
 		 403 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>