23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1563 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1563  Lycopene beta and epsilon cyclase  100 
 
 		 391 aa  801    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0382  Lycopene beta and epsilon cyclase  58.42 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1488  Lycopene beta and epsilon cyclase  52.63 
 
 		 388 aa  402  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000548703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0447  Lycopene beta and epsilon cyclase  44.42 
 
 		 393 aa  326  5e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0926  lycopene beta and epsilon cyclase  38.12 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294994  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3088  putative lycopene cyclase  40.2 
 
 		 393 aa  236  8e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00930  putative lycopene cyclase  32.89 
 
 		 383 aa  234  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2408  lycopene beta and epsilon cyclase  39.04 
 
 		 419 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2557  lycopene beta and epsilon cyclase  38.36 
 
 		 416 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329611  decreased coverage  0.00000286937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4955  Lycopene beta and epsilon cyclase  32.29 
 
 		 388 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127751  normal  0.0780528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3568  Lycopene beta and epsilon cyclase  35.68 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0091  Lycopene beta and epsilon cyclase  37.4 
 
 		 382 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.457408  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  30.75 
 
 		 417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02164  hypothetical protein  27.18 
 
 		 385 aa  123  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3060  lycopene beta and epsilon cyclase  26.95 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2209  lycopene cyclase  27.21 
 
 		 384 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  25.08 
 
 		 528 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3135  lycopene cyclase  26.02 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11261  putative lycopene beta cyclase  23.08 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09161  putative lycopene beta cyclase  23.73 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2838  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.75 
 
 		 555 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3576  lycopene cyclase  32.56 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  24.35 
 
 		 442 aa  42.7  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>