20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02164 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02164  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  808    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0382  Lycopene beta and epsilon cyclase  28.17 
 
 		 397 aa  146  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  27.94 
 
 		 417 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1563  Lycopene beta and epsilon cyclase  27.18 
 
 		 391 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1488  Lycopene beta and epsilon cyclase  27.69 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000548703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0447  Lycopene beta and epsilon cyclase  25.37 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00930  putative lycopene cyclase  24.42 
 
 		 383 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2408  lycopene beta and epsilon cyclase  25.33 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0926  lycopene beta and epsilon cyclase  23.83 
 
 		 389 aa  96.3  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294994  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3088  putative lycopene cyclase  25.68 
 
 		 393 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2557  lycopene beta and epsilon cyclase  25.99 
 
 		 416 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329611  decreased coverage  0.00000286937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4955  Lycopene beta and epsilon cyclase  23.42 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127751  normal  0.0780528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0091  Lycopene beta and epsilon cyclase  24.36 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.457408  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3568  Lycopene beta and epsilon cyclase  23.36 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3576  lycopene cyclase  24.42 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1713  lycopene cyclase  26.4 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0564818  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3135  lycopene cyclase  25.25 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2209  lycopene cyclase  24.19 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3060  lycopene beta and epsilon cyclase  22.76 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1817  lycopene cyclase  23.94 
 
 		 398 aa  46.6  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>