17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00930 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00930  putative lycopene cyclase  100 
 
 		 383 aa  779    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0382  Lycopene beta and epsilon cyclase  34.4 
 
 		 397 aa  257  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0926  lycopene beta and epsilon cyclase  36.72 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294994  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1488  Lycopene beta and epsilon cyclase  36.39 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000548703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0447  Lycopene beta and epsilon cyclase  34.18 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1563  Lycopene beta and epsilon cyclase  32.89 
 
 		 391 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3088  putative lycopene cyclase  28.34 
 
 		 393 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4955  Lycopene beta and epsilon cyclase  29.26 
 
 		 388 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127751  normal  0.0780528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3568  Lycopene beta and epsilon cyclase  28.57 
 
 		 410 aa  182  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2408  lycopene beta and epsilon cyclase  27.38 
 
 		 419 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2557  lycopene beta and epsilon cyclase  27.95 
 
 		 416 aa  176  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329611  decreased coverage  0.00000286937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0091  Lycopene beta and epsilon cyclase  26.45 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.457408  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  25 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02164  hypothetical protein  24.42 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3060  lycopene beta and epsilon cyclase  23.69 
 
 		 401 aa  96.3  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2209  lycopene cyclase  21.38 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3135  lycopene cyclase  18.94 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>