17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3060 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3060  lycopene beta and epsilon cyclase  100 
 
 		 401 aa  786    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00930  putative lycopene cyclase  23.68 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0157351  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1488  Lycopene beta and epsilon cyclase  29.38 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000548703 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4955  Lycopene beta and epsilon cyclase  24.72 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127751  normal  0.0780528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3568  Lycopene beta and epsilon cyclase  30 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0926  lycopene beta and epsilon cyclase  24.51 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294994  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0382  Lycopene beta and epsilon cyclase  26.82 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0447  Lycopene beta and epsilon cyclase  22.37 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1563  Lycopene beta and epsilon cyclase  26.43 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2408  lycopene beta and epsilon cyclase  26.42 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0091  Lycopene beta and epsilon cyclase  30.25 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.457408  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2557  lycopene beta and epsilon cyclase  27.73 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329611  decreased coverage  0.00000286937 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3088  putative lycopene cyclase  25.21 
 
 		 393 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02164  hypothetical protein  21.18 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  24.76 
 
 		 528 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  28.64 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0857  lycopene cyclase, beta and epsilon  28.66 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.27031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>