35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_06951 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0073  lycopene cyclase (CrtL-type)  98.6 
 
 		 428 aa  869    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06951  putative lycopene epsilon cyclase  100 
 
 		 428 aa  882    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07411  putative lycopene epsilon cyclase  66.67 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0418129  normal  0.37911 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23511  putative lycopene epsilon cyclase  64.22 
 
 		 426 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06991  putative lycopene epsilon cyclase  60.33 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.28746  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0633  lycopene cyclase (CrtL-type)  60.09 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06601  putative lycopene epsilon cyclase  59.86 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06891  putative lycopene epsilon cyclase  60.1 
 
 		 422 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.895812  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2062  lycopene cyclase (CrtL-type)  52.52 
 
 		 411 aa  458  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1941  lycopene cyclase (CrtL-type)  51.99 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09161  putative lycopene beta cyclase  50.49 
 
 		 408 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11541  putative lycopene beta cyclase  51.24 
 
 		 403 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0749733  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0688  lycopene cyclase (CrtL-type)  47.33 
 
 		 414 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.103999  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0724  lycopene cyclase, beta and epsilon  51.86 
 
 		 407 aa  408  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15221  putative lycopene beta cyclase  47.33 
 
 		 414 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11261  putative lycopene beta cyclase  50.25 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11691  putative lycopene beta cyclase  50.86 
 
 		 403 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.451912  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  50.12 
 
 		 403 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1075  lycopene cyclase (CrtL-type)  49.38 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2643  lycopene cyclase family protein  44.52 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2711  lycopene cyclase family protein  44.74 
 
 		 413 aa  355  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  35.12 
 
 		 442 aa  213  5.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0857  lycopene cyclase, beta and epsilon  34.85 
 
 		 435 aa  202  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.27031 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  29.9 
 
 		 528 aa  184  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5914  lycopene cyclase family protein  31.45 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0950  lycopene cyclase family protein  31.91 
 
 		 401 aa  176  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.75613 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56484  precursor of cyclase lycopene beta cyclase  31.9 
 
 		 659 aa  174  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00169655  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2394  lycopene cyclase family protein  28.27 
 
 		 374 aa  129  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.990938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5144  lycopene cyclase family protein  30.69 
 
 		 359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2495  Lycopene beta and epsilon cyclase  24.01 
 
 		 351 aa  63.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2209  lycopene cyclase  24.3 
 
 		 384 aa  57  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 		 393 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  26.15 
 
 		 417 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  21.41 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  26.83 
 
 		 379 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>