30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_06891 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0633  lycopene cyclase (CrtL-type)  95.97 
 
 
427 aa  852    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06601  putative lycopene epsilon cyclase  99.76 
 
 
427 aa  874    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06891  putative lycopene epsilon cyclase  100 
 
 
422 aa  875    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.895812  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06991  putative lycopene epsilon cyclase  90.52 
 
 
427 aa  808    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.28746  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06951  putative lycopene epsilon cyclase  60.1 
 
 
428 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0073  lycopene cyclase (CrtL-type)  60.1 
 
 
428 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07411  putative lycopene epsilon cyclase  60 
 
 
427 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0418129  normal  0.37911 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23511  putative lycopene epsilon cyclase  60.77 
 
 
426 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1941  lycopene cyclase (CrtL-type)  48.88 
 
 
412 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2062  lycopene cyclase (CrtL-type)  48.45 
 
 
411 aa  428  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0688  lycopene cyclase (CrtL-type)  48.18 
 
 
414 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.103999  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15221  putative lycopene beta cyclase  48.18 
 
 
414 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09161  putative lycopene beta cyclase  46.4 
 
 
408 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2643  lycopene cyclase family protein  45.43 
 
 
413 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0724  lycopene cyclase, beta and epsilon  49.75 
 
 
407 aa  398  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11261  putative lycopene beta cyclase  49.38 
 
 
407 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11541  putative lycopene beta cyclase  46.52 
 
 
403 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0749733  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11691  putative lycopene beta cyclase  47.65 
 
 
403 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.451912  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  47.41 
 
 
403 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1075  lycopene cyclase (CrtL-type)  47.16 
 
 
403 aa  362  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2711  lycopene cyclase family protein  42.69 
 
 
413 aa  362  6e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  31.01 
 
 
442 aa  203  6e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  30.15 
 
 
528 aa  193  5e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0950  lycopene cyclase family protein  31.22 
 
 
401 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.75613 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56484  precursor of cyclase lycopene beta cyclase  31.19 
 
 
659 aa  171  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00169655  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0857  lycopene cyclase, beta and epsilon  30.92 
 
 
435 aa  170  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.27031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5914  lycopene cyclase family protein  29.41 
 
 
399 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2394  lycopene cyclase family protein  27.23 
 
 
374 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.990938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5144  lycopene cyclase family protein  27.49 
 
 
359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2495  Lycopene beta and epsilon cyclase  25.08 
 
 
351 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>