57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2948 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2948  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 430 aa  850    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284077  normal  0.479686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2472  monooxygenase FAD-binding  81.78 
 
 		 430 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2304  FAD dependent oxidoreductase  79.77 
 
 		 430 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2979  aromatic-ring hydroxylase  61.57 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0759  hypothetical protein  53.14 
 
 		 447 aa  348  8e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1702  PimS2 protein  32.49 
 
 		 416 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.665919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  23.36 
 
 		 488 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5262  hypothetical protein  27.7 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6678  tryptophan halogenase  27.35 
 
 		 506 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  27.83 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  27.83 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  25.53 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  26.06 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  25.63 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  24.51 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  22.43 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.56 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2750  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  28.52 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  25.44 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  24.92 
 
 		 444 aa  57  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  21.51 
 
 		 506 aa  56.6  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  25.44 
 
 		 449 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3529  monooxygenase FAD-binding  28.87 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174105  decreased coverage  0.00232713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  25.25 
 
 		 495 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  23.84 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.82 
 
 		 445 aa  55.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.65 
 
 		 455 aa  54.3  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  23.96 
 
 		 455 aa  53.1  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  24.17 
 
 		 470 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  24.84 
 
 		 413 aa  53.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 344 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  23.03 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4289  monooxygenase FAD-binding  23.63 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  23.17 
 
 		 415 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  24.33 
 
 		 491 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  25.47 
 
 		 439 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  24.63 
 
 		 480 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0816  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  25.13 
 
 		 404 aa  50.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0931067  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  24.63 
 
 		 480 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  22.69 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  23.81 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1021  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  24.63 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  24.63 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  24.49 
 
 		 380 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  22.1 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  22.53 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5104  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.35 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  32.37 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  32.37 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1705  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  27.73 
 
 		 399 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  25.13 
 
 		 424 aa  43.1  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>