76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2472 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2472  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 430 aa  845    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2948  monooxygenase FAD-binding  81.4 
 
 		 430 aa  687    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284077  normal  0.479686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2304  FAD dependent oxidoreductase  90.44 
 
 		 430 aa  706    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2979  aromatic-ring hydroxylase  60.24 
 
 		 434 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0759  hypothetical protein  55.97 
 
 		 447 aa  354  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1702  PimS2 protein  34.74 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.665919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  23.16 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5262  hypothetical protein  28.49 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  27.39 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  27.93 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  24.59 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.23 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6678  tryptophan halogenase  27.37 
 
 		 506 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  25.67 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  25.21 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  25.21 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  22.41 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  25.1 
 
 		 449 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.54 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  25.59 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3529  monooxygenase FAD-binding  27.4 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174105  decreased coverage  0.00232713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2750  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  27.8 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  26.55 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  25.66 
 
 		 480 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  25.66 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  25.66 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  25.66 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  21.97 
 
 		 584 aa  53.9  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  21.28 
 
 		 455 aa  53.5  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.12 
 
 		 455 aa  53.5  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  21.63 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  21.39 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  24.6 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1021  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  21.92 
 
 		 444 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  24.18 
 
 		 444 aa  50.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  23.92 
 
 		 413 aa  50.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  21.97 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  22.83 
 
 		 476 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  26.9 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  26.65 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  23.55 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.76 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  28.16 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  22.15 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4289  monooxygenase FAD-binding  25.17 
 
 		 372 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  23.12 
 
 		 441 aa  46.6  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.85 
 
 		 380 aa  46.6  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  24.65 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  25.79 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  24.13 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  25.08 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5651  monooxygenase FAD-binding  34.96 
 
 		 547 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  20.95 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  23.28 
 
 		 587 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  23.78 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  28.67 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  24.09 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  25.11 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  27.25 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0816  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  21.67 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0931067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  25.22 
 
 		 344 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  22.35 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  23.41 
 
 		 618 aa  44.3  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1187  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  28.49 
 
 		 403 aa  43.5  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.829618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  23.43 
 
 		 429 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>