127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6678 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6678  tryptophan halogenase  100 
 
 		 506 aa  1011    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  34.76 
 
 		 488 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  23.61 
 
 		 482 aa  91.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  27.08 
 
 		 356 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  27.35 
 
 		 356 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  28.61 
 
 		 506 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  26.94 
 
 		 401 aa  88.6  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  25.46 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2948  monooxygenase FAD-binding  28.18 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284077  normal  0.479686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  30.67 
 
 		 507 aa  80.1  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0759  hypothetical protein  30.38 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  25.9 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  26.09 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  25.26 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  24.23 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  25.2 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  29.28 
 
 		 413 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  29.02 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  29.43 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  24.12 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  23.98 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.56 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.32 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  28.03 
 
 		 424 aa  67  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  24.18 
 
 		 413 aa  67  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  30.72 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  23.76 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  30.46 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  29.57 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3529  monooxygenase FAD-binding  28.19 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174105  decreased coverage  0.00232713 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.14 
 
 		 413 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2979  aromatic-ring hydroxylase  27.24 
 
 		 434 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  23.95 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  26.9 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  23.94 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  23.95 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  23.95 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  26.3 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  27.01 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2304  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  23.73 
 
 		 429 aa  62  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  22.89 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  26.05 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  24.01 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  23.95 
 
 		 429 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2472  monooxygenase FAD-binding  30 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  26.83 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  27.22 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  26.83 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  26.83 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  26.83 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  24.31 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  24.01 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  25.77 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  26.07 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  23.55 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  25.77 
 
 		 435 aa  57  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  25.93 
 
 		 436 aa  56.6  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1702  PimS2 protein  28.34 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.665919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 443 aa  55.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  21.62 
 
 		 455 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  26.58 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  26.33 
 
 		 455 aa  54.7  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  23.55 
 
 		 416 aa  54.3  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  35.94 
 
 		 414 aa  54.3  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.16 
 
 		 384 aa  53.9  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  23.97 
 
 		 647 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  21.7 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  27.51 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  26.8 
 
 		 417 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  27.51 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  26.63 
 
 		 424 aa  52.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  23.71 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  23.71 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.13 
 
 		 376 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  23.04 
 
 		 413 aa  50.8  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  24.84 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  24.46 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  25.93 
 
 		 368 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  37.14 
 
 		 430 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  32.65 
 
 		 584 aa  48.5  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  22.78 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  22.38 
 
 		 584 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  21.15 
 
 		 379 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  26.28 
 
 		 494 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.2 
 
 		 449 aa  48.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.23 
 
 		 567 aa  47.8  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  28.83 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0881  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  31.58 
 
 		 585 aa  47.4  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  25.89 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 344 aa  47  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.33 
 
 		 464 aa  47  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  23.94 
 
 		 618 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  22.91 
 
 		 408 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  25.73 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  22.15 
 
 		 377 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>