56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0759 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0759  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  874    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2979  aromatic-ring hydroxylase  52 
 
 
434 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2948  monooxygenase FAD-binding  53.14 
 
 
430 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284077  normal  0.479686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2304  FAD dependent oxidoreductase  55.28 
 
 
430 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2472  monooxygenase FAD-binding  55.11 
 
 
430 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1702  PimS2 protein  34.87 
 
 
416 aa  130  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.665919  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6678  tryptophan halogenase  28.69 
 
 
506 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  26.25 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  24.65 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  24.1 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  27.25 
 
 
470 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  20.95 
 
 
482 aa  71.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3529  monooxygenase FAD-binding  28.4 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174105  decreased coverage  0.00232713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  25.41 
 
 
488 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  26.39 
 
 
506 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  22.32 
 
 
439 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.42 
 
 
455 aa  65.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  22.32 
 
 
439 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.38 
 
 
449 aa  65.1  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.42 
 
 
445 aa  64.7  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.05 
 
 
444 aa  63.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  24.17 
 
 
444 aa  63.5  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  23.03 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  25.08 
 
 
461 aa  60.1  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5262  hypothetical protein  25.22 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  24.16 
 
 
455 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  25.69 
 
 
413 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  24.23 
 
 
618 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  21.84 
 
 
584 aa  54.3  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.74 
 
 
413 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4289  monooxygenase FAD-binding  29.67 
 
 
372 aa  53.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  24.69 
 
 
405 aa  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  26.26 
 
 
507 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3032  hypothetical protein  26.97 
 
 
217 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  24.61 
 
 
491 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  24.09 
 
 
439 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  22.56 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  22.61 
 
 
449 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  24.15 
 
 
379 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  23.58 
 
 
480 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1705  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 
366 aa  47  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  20.73 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  23.73 
 
 
495 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  26.01 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  24.68 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  23.99 
 
 
424 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  26.71 
 
 
395 aa  44.3  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0716636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  25.48 
 
 
587 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  29.7 
 
 
550 aa  44.3  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  23.01 
 
 
444 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 
417 aa  43.9  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  27.35 
 
 
429 aa  43.1  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 
344 aa  43.1  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>