More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2083 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 344 aa  700    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  28.49 
 
 		 444 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  29.16 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.96 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  28.3 
 
 		 441 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  27.76 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  25.9 
 
 		 480 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  27.44 
 
 		 444 aa  99  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  26.1 
 
 		 461 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  27.7 
 
 		 470 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  30.72 
 
 		 491 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  26.47 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  26.47 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  27.17 
 
 		 480 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  27.17 
 
 		 480 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  28.91 
 
 		 449 aa  93.2  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  27.22 
 
 		 414 aa  93.2  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.4 
 
 		 449 aa  93.2  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  27.17 
 
 		 480 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  27.17 
 
 		 480 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.02 
 
 		 445 aa  89.7  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  27.48 
 
 		 587 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  27.44 
 
 		 488 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  25.45 
 
 		 455 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  26.9 
 
 		 495 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  27.9 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.82 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  24.52 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  24.87 
 
 		 415 aa  82.8  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  25.66 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  28.29 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  28.29 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  29.19 
 
 		 422 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  30.16 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.46 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  27.56 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  25.7 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  28.18 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  25.39 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  28.44 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  27.03 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  25.15 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  26.29 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  27.49 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  27.36 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  26.67 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  27.03 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  24.3 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27.7 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  27.1 
 
 		 435 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.79 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  26.52 
 
 		 445 aa  72.8  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 411 aa  72.8  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  23.85 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  24.76 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  26.3 
 
 		 507 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 419 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  25.54 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  24.92 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  25.54 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  26.87 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  27.99 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  23.35 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  24.06 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  28.57 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  27.99 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  22.71 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.92 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2948  monooxygenase FAD-binding  25.36 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284077  normal  0.479686 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  25.23 
 
 		 647 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  23.88 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  26.46 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  26.55 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  28.05 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  29.73 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  21.78 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  32.18 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  25.63 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  25.37 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  22.97 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  25.53 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  25.58 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  32.74 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.32 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25.48 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  28.46 
 
 		 618 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 423 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  24.86 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>