102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0291 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
361 aa  712    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 
356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  28.76 
 
 
482 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  31.52 
 
 
356 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  33.42 
 
 
401 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  30.47 
 
 
356 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 
372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4289  monooxygenase FAD-binding  26.86 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3529  monooxygenase FAD-binding  29.8 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174105  decreased coverage  0.00232713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2750  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  32.93 
 
 
366 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  29.87 
 
 
488 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1021  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2948  monooxygenase FAD-binding  27.97 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284077  normal  0.479686 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6678  tryptophan halogenase  27.54 
 
 
506 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5262  hypothetical protein  27.61 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  24.32 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2979  aromatic-ring hydroxylase  27.33 
 
 
434 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  27.04 
 
 
491 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.07 
 
 
455 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  23.98 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  26.77 
 
 
506 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2304  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 
430 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  25.45 
 
 
587 aa  62.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  24.62 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 
398 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  23.01 
 
 
444 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  26.16 
 
 
444 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0759  hypothetical protein  28.89 
 
 
447 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  23.92 
 
 
480 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  27.44 
 
 
409 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  25.66 
 
 
470 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  20.83 
 
 
424 aa  57.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  23.86 
 
 
420 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  27.96 
 
 
413 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  25.82 
 
 
441 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.38 
 
 
445 aa  56.6  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  25.52 
 
 
461 aa  56.6  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2472  monooxygenase FAD-binding  26.9 
 
 
430 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  21.75 
 
 
429 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  21.75 
 
 
429 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.22 
 
 
376 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  22.35 
 
 
413 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  20.72 
 
 
415 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  21.04 
 
 
429 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  22.09 
 
 
414 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  25.51 
 
 
439 aa  53.1  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  25.51 
 
 
439 aa  53.1  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  21.45 
 
 
429 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  26.06 
 
 
618 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  20.87 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  19.35 
 
 
424 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  21.07 
 
 
409 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  24.85 
 
 
429 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  19.27 
 
 
413 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  21.21 
 
 
422 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  22.12 
 
 
429 aa  51.2  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  24.4 
 
 
416 aa  50.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  25.28 
 
 
647 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
344 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1705  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
366 aa  50.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  23.28 
 
 
377 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.17 
 
 
449 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  22.78 
 
 
792 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  20.92 
 
 
444 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  22.78 
 
 
792 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  21.78 
 
 
416 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 
455 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  24.62 
 
 
507 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  21.15 
 
 
405 aa  47.8  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  21.65 
 
 
370 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  21.79 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  25.6 
 
 
429 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  20.83 
 
 
420 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  24.49 
 
 
480 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  20.12 
 
 
435 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  24.49 
 
 
480 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  24.49 
 
 
480 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4927  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.5 
 
 
435 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3104  monooxygenase, FAD-binding  25.75 
 
 
373 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  24.49 
 
 
480 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  23.78 
 
 
584 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  22.42 
 
 
476 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  24.84 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  20.48 
 
 
415 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  22.36 
 
 
775 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  22.07 
 
 
785 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  19.94 
 
 
436 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  22.39 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  19.82 
 
 
435 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  19.82 
 
 
435 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  23.8 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 
360 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 
457 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  26.92 
 
 
436 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3653  monooxygenase FAD-binding  24.85 
 
 
411 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 
421 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  27.8 
 
 
568 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  23.4 
 
 
776 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  22.98 
 
 
455 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  26.14 
 
 
711 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>