More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4888 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  58.78 
 
 		 778 aa  924    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  56.65 
 
 		 772 aa  882    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  61.2 
 
 		 785 aa  951    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  57.16 
 
 		 774 aa  910    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.9 
 
 		 782 aa  945    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  54.14 
 
 		 771 aa  850    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.52 
 
 		 792 aa  923    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.92 
 
 		 790 aa  927    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.29 
 
 		 790 aa  936    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.8 
 
 		 789 aa  937    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.44 
 
 		 784 aa  754    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  54.17 
 
 		 777 aa  857    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.01 
 
 		 775 aa  995    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  57.79 
 
 		 822 aa  924    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  53.75 
 
 		 782 aa  816    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.4 
 
 		 790 aa  676    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.52 
 
 		 792 aa  923    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  58.35 
 
 		 764 aa  918    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  58.47 
 
 		 777 aa  936    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.16 
 
 		 790 aa  930    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  50.64 
 
 		 791 aa  723    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.92 
 
 		 791 aa  957    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.39 
 
 		 752 aa  691    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  57.31 
 
 		 764 aa  910    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 		 776 aa  1588    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  61.66 
 
 		 771 aa  971    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.91 
 
 		 780 aa  785    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.18 
 
 		 782 aa  920    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  60.85 
 
 		 761 aa  942    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  56.69 
 
 		 804 aa  876    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  57.51 
 
 		 761 aa  894    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  47.54 
 
 		 368 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.29 
 
 		 368 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4139  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48 
 
 		 368 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  46.99 
 
 		 368 aa  319  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.28 
 
 		 368 aa  317  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1086  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.14 
 
 		 368 aa  313  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.61 
 
 		 356 aa  313  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.57 
 
 		 368 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.139205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1036  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.86 
 
 		 368 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.44 
 
 		 361 aa  310  9e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4320  monooxygenase FAD-binding protein  46.07 
 
 		 400 aa  309  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  47.95 
 
 		 712 aa  308  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1489  xenobiotic reductase, putative  46 
 
 		 368 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.29 
 
 		 368 aa  306  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  47.56 
 
 		 365 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0702  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  47.13 
 
 		 370 aa  304  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00458318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1577  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  48.46 
 
 		 370 aa  303  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.44 
 
 		 355 aa  302  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3342  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  46.26 
 
 		 370 aa  303  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  48.16 
 
 		 358 aa  302  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1866  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.16 
 
 		 358 aa  302  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7562  NADPH dehydrogenase  43.49 
 
 		 370 aa  300  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  47.58 
 
 		 359 aa  300  8e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  45.69 
 
 		 370 aa  297  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.55 
 
 		 370 aa  297  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.316093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.28 
 
 		 387 aa  297  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427162  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4010  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  45.69 
 
 		 370 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4082  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  45.69 
 
 		 370 aa  296  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1165  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.66 
 
 		 356 aa  294  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3810  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46 
 
 		 356 aa  291  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0991  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.44 
 
 		 387 aa  291  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0239278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.69 
 
 		 370 aa  291  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4317  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.32 
 
 		 371 aa  291  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2083  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.74 
 
 		 353 aa  290  8e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  42.02 
 
 		 377 aa  290  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2592  monooxygenase, FAD-binding  45.22 
 
 		 404 aa  289  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2205  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.54 
 
 		 372 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2248  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.13 
 
 		 372 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.674578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1224  monooxygenase FAD-binding  45.72 
 
 		 413 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0821266  normal  0.977549 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4859  putative NADH-depentdent flavin oxidoreductase  42.98 
 
 		 371 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563143  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2523  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.13 
 
 		 372 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0620053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2134  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.89 
 
 		 353 aa  288  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000241293  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.16 
 
 		 369 aa  287  4e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1109  monooxygenase FAD-binding  47.49 
 
 		 413 aa  286  7e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.07 
 
 		 356 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.957099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.99 
 
 		 370 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2178  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.61 
 
 		 354 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5918  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.79 
 
 		 352 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1385  monooxygenase FAD-binding  45.13 
 
 		 413 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.75 
 
 		 373 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2687  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.3 
 
 		 373 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2608  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.27 
 
 		 371 aa  283  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1649  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.84 
 
 		 365 aa  282  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3839  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.14 
 
 		 352 aa  282  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.431413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0090  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.26 
 
 		 370 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3253  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.4 
 
 		 370 aa  281  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0005  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  44.83 
 
 		 370 aa  281  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0144  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.83 
 
 		 367 aa  281  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2983  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.98 
 
 		 370 aa  280  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.69 
 
 		 370 aa  280  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.98 
 
 		 370 aa  280  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5174  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.89 
 
 		 387 aa  280  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4902  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.74 
 
 		 358 aa  280  9e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3927  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.25 
 
 		 370 aa  280  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0013465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1442  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.45 
 
 		 357 aa  279  2e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  46.42 
 
 		 354 aa  278  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.7 
 
 		 354 aa  278  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.818781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2779  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.99 
 
 		 354 aa  276  8e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.487113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0063  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.4 
 
 		 370 aa  276  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>