123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2592 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2592  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 404 aa  816    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4331  monooxygenase FAD-binding  65.95 
 
 		 451 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  46.93 
 
 		 771 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1385  monooxygenase FAD-binding  50.29 
 
 		 413 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1224  monooxygenase FAD-binding  50 
 
 		 413 aa  323  5e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0821266  normal  0.977549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1109  monooxygenase FAD-binding  50 
 
 		 413 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4320  monooxygenase FAD-binding protein  46.83 
 
 		 400 aa  315  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  45.38 
 
 		 761 aa  302  7.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  42.7 
 
 		 771 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  42.46 
 
 		 764 aa  293  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.22 
 
 		 776 aa  290  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  44.41 
 
 		 790 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.01 
 
 		 764 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  42.78 
 
 		 761 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  42.82 
 
 		 785 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.86 
 
 		 782 aa  272  8.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.52 
 
 		 790 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.79 
 
 		 790 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.76 
 
 		 792 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.76 
 
 		 792 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.95 
 
 		 772 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  42.25 
 
 		 791 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  42.55 
 
 		 822 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.98 
 
 		 789 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.27 
 
 		 775 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.4 
 
 		 777 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.27 
 
 		 777 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.27 
 
 		 774 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.41 
 
 		 778 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.03 
 
 		 782 aa  246  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7497  putative aromatic-ring hydroxylase  38.38 
 
 		 379 aa  236  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.25 
 
 		 804 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5101  monooxygenase, FAD-binding  36.13 
 
 		 381 aa  233  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.889142  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  38.1 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.99 
 
 		 790 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.06 
 
 		 752 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  37.46 
 
 		 782 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0171  monooxygenase, FAD-binding  35.96 
 
 		 381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.19 
 
 		 791 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.24 
 
 		 780 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.86 
 
 		 784 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  38.19 
 
 		 712 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3779  putative monooxygenase, FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  34.34 
 
 		 386 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4123  monooxygenase, FAD-binding  34.64 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.058408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4903  monooxygenase, FAD-binding  33.89 
 
 		 379 aa  196  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3101  monooxygenase, FAD-binding  34.16 
 
 		 384 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  25.15 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2043  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  26.78 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.84 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  29.26 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  26.69 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  25.76 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  24.85 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  25.42 
 
 		 408 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  25.62 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  27.43 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  27.43 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0399  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0918847  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  25.75 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  29.85 
 
 		 423 aa  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  26.72 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  28.02 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  25.07 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  27.68 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3501  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  29.56 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175144  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  24.62 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  25.07 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  27.94 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  24.14 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  27.43 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  25.76 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  29.44 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  45.28 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  24.66 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  46.43 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00851  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  38.37 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.251973  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0232  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  31.07 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  30 
 
 		 384 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  25.54 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5221  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  31.47 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  32.99 
 
 		 400 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  47.37 
 
 		 379 aa  46.6  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  25.37 
 
 		 415 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  42.31 
 
 		 373 aa  46.6  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2762  putative 2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  29.38 
 
 		 396 aa  46.6  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  22.49 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  24.48 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  23.85 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08199  MAK1-like monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12060)  29.41 
 
 		 469 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.167964 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  30.21 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  27.1 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  27.1 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  27.1 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  37.68 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3854  monooxygenase FAD-binding protein  28.57 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  40 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  23.11 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  24.32 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  24.24 
 
 		 388 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>