More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2705 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  100 
 
 
423 aa  830    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  62.28 
 
 
392 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  48.35 
 
 
393 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  47.37 
 
 
399 aa  332  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  43.32 
 
 
408 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  44.89 
 
 
408 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  44.72 
 
 
408 aa  292  9e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  45.64 
 
 
408 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  43.26 
 
 
401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  44.62 
 
 
392 aa  266  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  42.26 
 
 
399 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  43 
 
 
402 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  41.1 
 
 
384 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8535  monooxygenase FAD-binding  37.01 
 
 
384 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.0015439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4263  monooxygenase FAD-binding  35.75 
 
 
398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000952252  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  30.67 
 
 
421 aa  158  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00140  conserved hypothetical protein  31.61 
 
 
419 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.180406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  29.77 
 
 
374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  27.48 
 
 
377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  30.92 
 
 
388 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  32.49 
 
 
376 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  32.3 
 
 
378 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  32.8 
 
 
382 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  27.69 
 
 
377 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08521  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06050)  27.64 
 
 
469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.883838  normal  0.0891916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  33.05 
 
 
382 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  30.11 
 
 
383 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  31.07 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  29.53 
 
 
392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  25.13 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  32.3 
 
 
420 aa  116  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  32.03 
 
 
377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  26.41 
 
 
377 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  29.89 
 
 
376 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  29.43 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  29.08 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  29.89 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.23 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  31.21 
 
 
379 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  31.18 
 
 
376 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  31.18 
 
 
376 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  31.05 
 
 
377 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  29.51 
 
 
373 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  29.46 
 
 
364 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  30.97 
 
 
402 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  29.18 
 
 
364 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  31.43 
 
 
376 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  29.07 
 
 
378 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  29.23 
 
 
360 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  32.11 
 
 
377 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  30.25 
 
 
371 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  27.74 
 
 
557 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  28.02 
 
 
385 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  30.53 
 
 
376 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  30.11 
 
 
382 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  31.43 
 
 
429 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  28.65 
 
 
396 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  29.43 
 
 
382 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  26.44 
 
 
369 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  25.12 
 
 
374 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  26.44 
 
 
369 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  27.08 
 
 
386 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  28.94 
 
 
400 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  29.01 
 
 
376 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  32.12 
 
 
382 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  27.51 
 
 
391 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  30.52 
 
 
410 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
425 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  29.11 
 
 
382 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  30.77 
 
 
387 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  28.92 
 
 
385 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  26.32 
 
 
372 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  28.28 
 
 
385 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  32.58 
 
 
389 aa  100  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0392  monooxygenase FAD-binding protein  34.93 
 
 
383 aa  100  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.890611  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  29.31 
 
 
385 aa  100  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  26.76 
 
 
368 aa  99.8  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  27.04 
 
 
368 aa  100  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  31.15 
 
 
392 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  27.95 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  32.01 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  31.15 
 
 
392 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  28.49 
 
 
385 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  28.49 
 
 
385 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  31.15 
 
 
392 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  33.97 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  28.57 
 
 
398 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  31.7 
 
 
421 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  31.31 
 
 
390 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  29.4 
 
 
385 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  29.51 
 
 
384 aa  97.1  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  29.69 
 
 
396 aa  96.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  28.69 
 
 
404 aa  96.3  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  29.83 
 
 
399 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  28.26 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  30.05 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  26.2 
 
 
376 aa  94.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  32.41 
 
 
393 aa  94.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  28.33 
 
 
388 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>