More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2657 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 377 aa  741    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  57.34 
 
 		 376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  57.88 
 
 		 376 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  53.11 
 
 		 378 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  44.38 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  44.11 
 
 		 368 aa  312  4.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  36.6 
 
 		 369 aa  153  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  36.25 
 
 		 369 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  31.86 
 
 		 379 aa  136  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  32.76 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  28.78 
 
 		 374 aa  132  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  32 
 
 		 377 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  37.61 
 
 		 378 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  30.55 
 
 		 376 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  33.7 
 
 		 388 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  30.56 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  31.41 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  36.05 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  35.56 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  35.56 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  31.25 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  30.91 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  33.16 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  33.98 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  31.82 
 
 		 402 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  33.23 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  33.64 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  28.5 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  34.91 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  31.86 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  33.04 
 
 		 388 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 385 aa  119  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  24.61 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  32.81 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  29.02 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.58 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  32.49 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  30.37 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  32.1 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.83 
 
 		 404 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  32.19 
 
 		 376 aa  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  32.41 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  29.19 
 
 		 392 aa  113  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  32.84 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  30.11 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  29.89 
 
 		 392 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  32.47 
 
 		 421 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  24.38 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.49 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  26.48 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  23.74 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  24.46 
 
 		 377 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  28.21 
 
 		 404 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  29.64 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1561  monooxygenase FAD-binding  34.67 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0688558  normal  0.0725424 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  24.8 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  28.66 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  30.77 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  29.71 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  28.69 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  30.56 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  29.63 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  28.61 
 
 		 403 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  29.44 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  33.43 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  27.78 
 
 		 421 aa  103  6e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  34.26 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  27.65 
 
 		 404 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  27.3 
 
 		 378 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  28.01 
 
 		 404 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  35.2 
 
 		 377 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  26.44 
 
 		 372 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  30.99 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  30.48 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  26.67 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  25.43 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  29.81 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  29.08 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  29.77 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  30.21 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  30.15 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  29.57 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  31.1 
 
 		 408 aa  99.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 		 392 aa  99.8  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  30.68 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  30.12 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  29.97 
 
 		 407 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  25.43 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  30.4 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  25.43 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  30.28 
 
 		 395 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  30.68 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  27.95 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  26.9 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  26.21 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  33.02 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  26.87 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  25.87 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  30.62 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>