More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4263 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4263  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 398 aa  788    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000952252  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  38.66 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  36.46 
 
 		 399 aa  196  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  37.88 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  37.06 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  37.04 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  35.84 
 
 		 408 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  34.09 
 
 		 408 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  33.83 
 
 		 408 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  32.57 
 
 		 399 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  34.26 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  33.58 
 
 		 401 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  33.95 
 
 		 392 aa  129  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  33.94 
 
 		 384 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  27.03 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  29.19 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08521  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06050)  31.48 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.883838  normal  0.0891916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8535  monooxygenase FAD-binding  32.11 
 
 		 384 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.0015439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  29.49 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  29.49 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  24.26 
 
 		 377 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  24.79 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  24.26 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  28.26 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  31.68 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  31.8 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  30.75 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  28.05 
 
 		 385 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  30.92 
 
 		 378 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  30.04 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  31.88 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  31.5 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  31.5 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  30.04 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  29.79 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  30.74 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  27.85 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  30.04 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  26.97 
 
 		 397 aa  99.4  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  29.88 
 
 		 390 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  30.04 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  30.2 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  30.49 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  27.27 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  31.38 
 
 		 386 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  31.17 
 
 		 404 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00140  conserved hypothetical protein  27.37 
 
 		 419 aa  96.3  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.180406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  29.94 
 
 		 384 aa  95.5  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  27.4 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  29.44 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  29.44 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  28.94 
 
 		 376 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  29 
 
 		 385 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  27.79 
 
 		 395 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  28.61 
 
 		 374 aa  93.2  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  27.8 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30 
 
 		 407 aa  91.3  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  30.42 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  28.78 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  28.85 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  27.67 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  25.97 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  32.24 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  29.14 
 
 		 420 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  29.3 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  27.78 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  28.31 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  26.72 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  29.83 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  29.48 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  26.83 
 
 		 377 aa  87  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  28.87 
 
 		 410 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  30.64 
 
 		 378 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  27.79 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  28.25 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  36.5 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  27.59 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  32.37 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  28.57 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  24.23 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  27.1 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  28.57 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  29.8 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  30.48 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  28.01 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  27.04 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  29.37 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  28.81 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  26.26 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  28.89 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  27.89 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  28.3 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2509  monooxygenase, FAD-binding  30.73 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  28.11 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  28.02 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  30.52 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  35.71 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>