More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1762 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
384 aa  768    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  86.2 
 
 
384 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  54.07 
 
 
389 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  43.04 
 
 
399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  35.8 
 
 
422 aa  252  7e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  40.61 
 
 
401 aa  249  8e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  40.36 
 
 
401 aa  246  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2548  salicylate hydroxylase  52.11 
 
 
221 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  40.36 
 
 
408 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  39.7 
 
 
404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  36.06 
 
 
398 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  36.88 
 
 
400 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  35.18 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  37.91 
 
 
412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  38.13 
 
 
400 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  38.32 
 
 
399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  36.36 
 
 
399 aa  180  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  37.8 
 
 
373 aa  179  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  34.45 
 
 
403 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  36.41 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  34.92 
 
 
395 aa  173  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  31.58 
 
 
401 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  38.46 
 
 
397 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  34.17 
 
 
396 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  32.01 
 
 
395 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  35.99 
 
 
394 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  34.38 
 
 
397 aa  169  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  34.62 
 
 
412 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  34.78 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  31.64 
 
 
397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  31.23 
 
 
425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  34.76 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  31.59 
 
 
402 aa  163  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  34.54 
 
 
410 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  34.78 
 
 
395 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  33.42 
 
 
398 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  33.16 
 
 
421 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  32.56 
 
 
390 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  35.86 
 
 
406 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  35.46 
 
 
412 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  32.54 
 
 
427 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  34.82 
 
 
391 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  32.31 
 
 
391 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  32.31 
 
 
391 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  31.22 
 
 
402 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  31.22 
 
 
402 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  32.56 
 
 
385 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  33.85 
 
 
406 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  28.8 
 
 
397 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  36.03 
 
 
407 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  30.95 
 
 
402 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  30.55 
 
 
402 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  29.74 
 
 
397 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  29.74 
 
 
397 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  29.74 
 
 
397 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  33.16 
 
 
414 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  29.74 
 
 
397 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  33.16 
 
 
414 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  29.74 
 
 
400 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  29.47 
 
 
397 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  31.47 
 
 
402 aa  149  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  32.91 
 
 
389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  30.65 
 
 
404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  29.1 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  32.37 
 
 
413 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  31.25 
 
 
377 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  30.4 
 
 
401 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  31.55 
 
 
444 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  32.32 
 
 
404 aa  142  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  30.67 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  27.99 
 
 
711 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  33.05 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  31.91 
 
 
422 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  28.61 
 
 
386 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  29.27 
 
 
396 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  31.91 
 
 
404 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  29.46 
 
 
382 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  30.11 
 
 
382 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.53 
 
 
414 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  29.62 
 
 
506 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  30.11 
 
 
403 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  27.9 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  29.83 
 
 
382 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  30.4 
 
 
386 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  30.57 
 
 
416 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  31.12 
 
 
430 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  33.77 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  31.04 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  29.18 
 
 
382 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.17 
 
 
426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.12 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  29.03 
 
 
383 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  30.57 
 
 
405 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  28.39 
 
 
421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  29.95 
 
 
402 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  30.6 
 
 
385 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  30.6 
 
 
385 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  29.88 
 
 
385 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  29.29 
 
 
385 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  29.02 
 
 
385 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>