More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6277 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  85.68 
 
 		 422 aa  720    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 405 aa  820    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  85.61 
 
 		 404 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  85.36 
 
 		 404 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  87.59 
 
 		 404 aa  727    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  71.11 
 
 		 404 aa  600  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  52.24 
 
 		 410 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  37.67 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  34.62 
 
 		 391 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  35.44 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  39.65 
 
 		 395 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  32.81 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  33.92 
 
 		 421 aa  196  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  33.08 
 
 		 397 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  31.81 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  30.91 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  33.8 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  33.83 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  33.71 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  33.16 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  33.04 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  35.28 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  32.09 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  31.85 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  31.18 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  33.16 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  32.95 
 
 		 382 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  33.24 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  31.9 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  32.09 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  32.17 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  32.17 
 
 		 385 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  32.17 
 
 		 385 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.55 
 
 		 414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  30.22 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  32.35 
 
 		 402 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  32.35 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  31.5 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  30.9 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  30.26 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  30.26 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.23 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  30.26 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  32.35 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  30.26 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  29.75 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  30 
 
 		 397 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  30.79 
 
 		 385 aa  159  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  34.5 
 
 		 412 aa  159  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.54 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  31.28 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  33.64 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  32.09 
 
 		 373 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  32.49 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  31.82 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  35.43 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  33.15 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  32.67 
 
 		 389 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  29.88 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  32.15 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  36.76 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  34.18 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  32.04 
 
 		 381 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  31.28 
 
 		 395 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  29.63 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  32.06 
 
 		 384 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  31.59 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  29.49 
 
 		 400 aa  149  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  32.81 
 
 		 412 aa  149  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  29.97 
 
 		 416 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  32.27 
 
 		 373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  31.55 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  32.44 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  31.5 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  34.99 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  31.34 
 
 		 404 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  31.63 
 
 		 384 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  32.55 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  32.49 
 
 		 389 aa  143  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  28.72 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  30.5 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  34.99 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  30.6 
 
 		 412 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  32.37 
 
 		 430 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  31.86 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  31.85 
 
 		 309 aa  137  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  30.11 
 
 		 384 aa  137  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  28.42 
 
 		 400 aa  136  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  27.49 
 
 		 422 aa  137  5e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  30.45 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  28.65 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04576  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01950)  27.96 
 
 		 459 aa  133  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.669089  normal  0.45987 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  28.61 
 
 		 506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  32.58 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  29.04 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  31.1 
 
 		 390 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  25.81 
 
 		 377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  28.61 
 
 		 444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0367059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>