More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4040 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  98.76 
 
 		 422 aa  804    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  91.34 
 
 		 404 aa  750    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  90.84 
 
 		 404 aa  754    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  85.36 
 
 		 405 aa  691    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  100 
 
 		 404 aa  814    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  72.39 
 
 		 404 aa  598  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  51.45 
 
 		 410 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  36.44 
 
 		 396 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  33.59 
 
 		 391 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  39.65 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  35.35 
 
 		 406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  34.16 
 
 		 403 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  33.5 
 
 		 397 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  35.38 
 
 		 385 aa  179  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  33.62 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  33 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  35.13 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  29.64 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  32.24 
 
 		 382 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  33.04 
 
 		 385 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  31.15 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  33.04 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  30.45 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  33.04 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  32.25 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  36.57 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  31.61 
 
 		 382 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  35.29 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  31.88 
 
 		 382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.75 
 
 		 447 aa  163  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  32.38 
 
 		 402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  29.55 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  31.91 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  31.46 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  28.76 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  32.54 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  29.71 
 
 		 378 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  31.69 
 
 		 388 aa  160  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  33.83 
 
 		 389 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  36 
 
 		 395 aa  159  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  32.84 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  31.83 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  30.83 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  31.72 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  29.87 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  30.79 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  31.72 
 
 		 402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  30.62 
 
 		 401 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  29.76 
 
 		 387 aa  156  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  31.55 
 
 		 427 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  29.88 
 
 		 385 aa  153  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  33.14 
 
 		 400 aa  152  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  34.32 
 
 		 412 aa  152  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.95 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  33.42 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  32.09 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  33.25 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  36.09 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  31.55 
 
 		 395 aa  150  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  31.14 
 
 		 381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  36.09 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  30.75 
 
 		 397 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  30.75 
 
 		 397 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  30.75 
 
 		 397 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  30.75 
 
 		 397 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  32.02 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  31.73 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  30.47 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  29.33 
 
 		 421 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  37.19 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04576  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01950)  28.85 
 
 		 459 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.669089  normal  0.45987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  29.97 
 
 		 416 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  27.65 
 
 		 422 aa  140  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  31.91 
 
 		 384 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  30.08 
 
 		 697 aa  139  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  31.23 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  31.32 
 
 		 403 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  31.93 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  31.04 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  31.27 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  31.09 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  31.95 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  30.63 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  29.52 
 
 		 448 aa  133  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  28.06 
 
 		 397 aa  133  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  32.07 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07902  conserved hypothetical protein  26.71 
 
 		 462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.286901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  28.74 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  32.09 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  28.65 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  30.05 
 
 		 506 aa  129  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  29.57 
 
 		 384 aa  129  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  32.07 
 
 		 396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  30.48 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  31.27 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03392  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17670)  32.51 
 
 		 710 aa  126  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.39217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  27.15 
 
 		 392 aa  126  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  31.93 
 
 		 390 aa  126  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  30.7 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>