More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56402 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  87.35 
 
 
411 aa  736    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  100 
 
 
426 aa  888    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  35.92 
 
 
447 aa  276  5e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0406434 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  33.33 
 
 
506 aa  248  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  35.73 
 
 
421 aa  236  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  35.73 
 
 
711 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01881  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04330)  43.57 
 
 
341 aa  231  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.390445  normal  0.393025 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  34.85 
 
 
397 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  37.26 
 
 
395 aa  216  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  33.58 
 
 
395 aa  210  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  32.14 
 
 
403 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  32.55 
 
 
400 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  33.58 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 
420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08200  conserved hypothetical protein  34.46 
 
 
448 aa  197  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54635  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  31.5 
 
 
391 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  32.04 
 
 
396 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  34.1 
 
 
421 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  33.25 
 
 
416 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04576  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01950)  32.89 
 
 
459 aa  194  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.669089  normal  0.45987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  32.92 
 
 
412 aa  193  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
397 aa  192  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  34.76 
 
 
395 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  35.05 
 
 
401 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  33.85 
 
 
406 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  32.77 
 
 
398 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  30.77 
 
 
399 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  30.38 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 
407 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  31.44 
 
 
399 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.29 
 
 
422 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  33.5 
 
 
412 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  32.41 
 
 
377 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  30.34 
 
 
400 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  31.12 
 
 
404 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  30.29 
 
 
404 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  33.25 
 
 
406 aa  179  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  32.88 
 
 
401 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  33.24 
 
 
397 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03392  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17670)  32.51 
 
 
710 aa  176  9e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.39217 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  30.1 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.36 
 
 
414 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  30.95 
 
 
405 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09161  conserved hypothetical protein  30.41 
 
 
426 aa  172  7.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0101824  normal  0.47594 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  28.83 
 
 
400 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  30.67 
 
 
402 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  31.43 
 
 
387 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  30.05 
 
 
400 aa  169  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  33.33 
 
 
386 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  33.15 
 
 
398 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  29.5 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  29.62 
 
 
394 aa  166  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  32.49 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  32.35 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  30.64 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05310  conserved hypothetical protein  29.4 
 
 
454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400667  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  33.25 
 
 
395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  30.66 
 
 
399 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02593  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01600)  32.65 
 
 
414 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.140818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  31.41 
 
 
402 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  28.99 
 
 
412 aa  159  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  27.79 
 
 
400 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  28.27 
 
 
410 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  32.06 
 
 
697 aa  159  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  30.18 
 
 
425 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  31.27 
 
 
384 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  30.99 
 
 
373 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  31.91 
 
 
391 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  31.91 
 
 
391 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  29.75 
 
 
430 aa  156  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  31.65 
 
 
390 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  28.35 
 
 
402 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  30.66 
 
 
385 aa  153  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  28.64 
 
 
413 aa  153  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  29.98 
 
 
389 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  29.6 
 
 
444 aa  151  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  29.68 
 
 
386 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  30.37 
 
 
389 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  27.69 
 
 
397 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  31.2 
 
 
427 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  32.1 
 
 
383 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  27.74 
 
 
402 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  33.06 
 
 
385 aa  150  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  28.19 
 
 
408 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  27.74 
 
 
402 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  28.43 
 
 
402 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  28.83 
 
 
422 aa  149  9e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  27.44 
 
 
397 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  27.44 
 
 
397 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  27.44 
 
 
397 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  27.44 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  29 
 
 
384 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  28.1 
 
 
402 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  30.64 
 
 
397 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  30.79 
 
 
384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  28.32 
 
 
427 aa  147  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  27.46 
 
 
403 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  27.44 
 
 
396 aa  146  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  31.99 
 
 
382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  29.75 
 
 
373 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>