More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50409 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  100 
 
 
447 aa  922    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0406434 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  37.77 
 
 
506 aa  293  4e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  36.15 
 
 
426 aa  257  3e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  36.34 
 
 
411 aa  256  7e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09161  conserved hypothetical protein  35.33 
 
 
426 aa  236  6e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0101824  normal  0.47594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  35.29 
 
 
421 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05310  conserved hypothetical protein  33.82 
 
 
454 aa  212  7.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400667  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  33.94 
 
 
711 aa  212  9e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  34.82 
 
 
397 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  35.04 
 
 
420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08200  conserved hypothetical protein  31.12 
 
 
448 aa  188  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54635  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  33.08 
 
 
391 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  31.87 
 
 
403 aa  183  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  32.23 
 
 
399 aa  179  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01881  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04330)  36.28 
 
 
341 aa  177  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.390445  normal  0.393025 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  32.52 
 
 
396 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  32 
 
 
395 aa  176  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  30.79 
 
 
404 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  33.11 
 
 
416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  30.75 
 
 
404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  30.58 
 
 
400 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  31.93 
 
 
377 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  32.44 
 
 
421 aa  160  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.33 
 
 
422 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  28.24 
 
 
404 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  30.66 
 
 
402 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  29.17 
 
 
410 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  29.87 
 
 
697 aa  153  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  31.25 
 
 
401 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  31.07 
 
 
406 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  35.5 
 
 
395 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  27.46 
 
 
404 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  30.14 
 
 
402 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  29.43 
 
 
397 aa  149  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  29.23 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  29.7 
 
 
397 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  30.14 
 
 
400 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  29.7 
 
 
397 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  29.7 
 
 
397 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  29.7 
 
 
397 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  29.56 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  29.76 
 
 
405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  30.14 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  30.14 
 
 
402 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  29.57 
 
 
412 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  29.35 
 
 
402 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  30.91 
 
 
389 aa  143  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  29.02 
 
 
400 aa  143  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  28.1 
 
 
400 aa  142  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04576  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01950)  26.5 
 
 
459 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.669089  normal  0.45987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  29.87 
 
 
425 aa  141  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  28.1 
 
 
400 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  29.18 
 
 
399 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  29.49 
 
 
403 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  29.91 
 
 
385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  30 
 
 
397 aa  136  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  28.66 
 
 
385 aa  136  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  30.66 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  27.07 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  29.13 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  28.68 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  28.31 
 
 
385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  29.37 
 
 
413 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  30.09 
 
 
386 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  30.03 
 
 
395 aa  133  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  28.66 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  32.21 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  29.12 
 
 
398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  28.13 
 
 
427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  31.79 
 
 
412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  27.81 
 
 
404 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  28.06 
 
 
412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  28.49 
 
 
404 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  29.01 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  30.58 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  27.49 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  27.49 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  30.58 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02593  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01600)  26.83 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.140818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  27.82 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  30.39 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  28.7 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  28.28 
 
 
384 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  27.59 
 
 
395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  26.77 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  30.4 
 
 
414 aa  126  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  27.19 
 
 
385 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  29.21 
 
 
382 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  28.97 
 
 
373 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  30.46 
 
 
384 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  29.62 
 
 
382 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  30.4 
 
 
414 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  29.57 
 
 
395 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  29.55 
 
 
382 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  27.66 
 
 
422 aa  124  5e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08470  conserved hypothetical protein  30.29 
 
 
366 aa  123  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.347235  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  26.92 
 
 
427 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.25 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  29.45 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 
382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>