More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3162 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 387 aa  782    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  69.47 
 
 		 402 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  70.28 
 
 		 381 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  58.49 
 
 		 377 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  64.29 
 
 		 373 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  45.55 
 
 		 386 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  38.23 
 
 		 385 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  38.77 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  38.96 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  38.96 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  38.7 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  38.79 
 
 		 385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  37.36 
 
 		 385 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  39.1 
 
 		 403 aa  252  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  38.42 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  37.89 
 
 		 378 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  38.07 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  37.57 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  37.85 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  37.4 
 
 		 383 aa  249  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  36.65 
 
 		 396 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  40.5 
 
 		 397 aa  232  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  39 
 
 		 385 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  35.26 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  41.44 
 
 		 400 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  39.02 
 
 		 406 aa  215  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  33.52 
 
 		 404 aa  195  9e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  33.72 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  36.83 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  38.41 
 
 		 400 aa  193  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  35.46 
 
 		 421 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  37.64 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  37.84 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  37.77 
 
 		 404 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  40.11 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  32.94 
 
 		 410 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  32.28 
 
 		 404 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  37.03 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  35.74 
 
 		 400 aa  177  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  37.53 
 
 		 395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  35.52 
 
 		 400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  37.95 
 
 		 412 aa  173  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  31.5 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  38.42 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  31.5 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  31.85 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  31.12 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  38.4 
 
 		 399 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  34.69 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.88 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  35.52 
 
 		 404 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  31.65 
 
 		 421 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  33.82 
 
 		 402 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  37.81 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  31.1 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.52 
 
 		 411 aa  163  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  35.59 
 
 		 373 aa  163  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  31.86 
 
 		 397 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  33.73 
 
 		 402 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  31.56 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  31.56 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  31.56 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  31.56 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  36.09 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  35.71 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  34.35 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  33.43 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  31.56 
 
 		 397 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  35.17 
 
 		 396 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  32.93 
 
 		 401 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  32.94 
 
 		 427 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  33.14 
 
 		 402 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  33.58 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  32.56 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  35.65 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  35.62 
 
 		 412 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  37.14 
 
 		 394 aa  156  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  31.76 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  34.78 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  31.91 
 
 		 427 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  34.15 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  31.23 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  35.31 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  31.23 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  31.23 
 
 		 390 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  31.01 
 
 		 697 aa  153  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 402 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  31.12 
 
 		 420 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  35.41 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  36.98 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 		 384 aa  149  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  34.68 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  35.67 
 
 		 414 aa  147  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  33.89 
 
 		 413 aa  146  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  35.21 
 
 		 414 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  28.02 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  33.63 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  34.56 
 
 		 364 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  34.56 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>