More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3669 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  89.34 
 
 		 400 aa  697    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  100 
 
 		 400 aa  827    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  79.3 
 
 		 402 aa  624  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  65.25 
 
 		 402 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  64.19 
 
 		 402 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  64.59 
 
 		 402 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  64.59 
 
 		 402 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  64.59 
 
 		 402 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  61.99 
 
 		 404 aa  494  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  62.93 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  62.67 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  62.4 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  62.4 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  62.4 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  62.13 
 
 		 397 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  61.83 
 
 		 403 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  60.59 
 
 		 427 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  44.17 
 
 		 396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  43.01 
 
 		 397 aa  289  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  37.88 
 
 		 401 aa  256  7e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  36.39 
 
 		 421 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  37.33 
 
 		 413 aa  226  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  36.46 
 
 		 414 aa  226  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  37.96 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  35.04 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  34.77 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  38.27 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  35.03 
 
 		 400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  36.24 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  33.67 
 
 		 395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  35.92 
 
 		 398 aa  215  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  35.34 
 
 		 396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  36.39 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  34.56 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  35.97 
 
 		 399 aa  207  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  34.59 
 
 		 425 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  34.49 
 
 		 403 aa  206  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  35.88 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  34.24 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  34.99 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  32.83 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  34.85 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  36.29 
 
 		 430 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  34.11 
 
 		 414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  35.1 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  34.11 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  34.81 
 
 		 395 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  34.61 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  35.36 
 
 		 397 aa  189  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  33.75 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  33.92 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  33.95 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  36.15 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  32.52 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  32.25 
 
 		 406 aa  176  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  34.16 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  33.52 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  33.77 
 
 		 406 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  33.92 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  30.96 
 
 		 404 aa  169  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  33.43 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  30.98 
 
 		 408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  31.46 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  32.4 
 
 		 397 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 382 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  30.46 
 
 		 384 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  33.02 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  33.02 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  30.05 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  32.72 
 
 		 382 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  29.8 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  29.54 
 
 		 447 aa  160  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  32.84 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  32.84 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  31.79 
 
 		 378 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  27.91 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 		 420 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.5 
 
 		 411 aa  159  8e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  32.34 
 
 		 390 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  29.82 
 
 		 384 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  32.14 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  32.14 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  28.91 
 
 		 385 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  31.95 
 
 		 410 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  30.61 
 
 		 385 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  32.14 
 
 		 385 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  31.5 
 
 		 383 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  30 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  31.92 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  29.71 
 
 		 386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  27.8 
 
 		 422 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  33.73 
 
 		 373 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  31.42 
 
 		 386 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  29.62 
 
 		 506 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  26.94 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  32.35 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  29.17 
 
 		 405 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08200  conserved hypothetical protein  30.54 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>