More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2055 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  81.03 
 
 
421 aa  645    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
416 aa  845    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  46.65 
 
 
401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  46.45 
 
 
414 aa  326  5e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  44.03 
 
 
430 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  41.39 
 
 
413 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  39.68 
 
 
397 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  39.13 
 
 
400 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  35.41 
 
 
400 aa  225  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  35.04 
 
 
400 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  36.66 
 
 
402 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  37.63 
 
 
402 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  37.37 
 
 
402 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  37.63 
 
 
402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  37.37 
 
 
402 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  36.99 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  37.37 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  39.2 
 
 
404 aa  220  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  33.59 
 
 
397 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  33.59 
 
 
397 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  33.59 
 
 
397 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  33.59 
 
 
397 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  33.59 
 
 
397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  35.88 
 
 
427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  33.42 
 
 
397 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  34.66 
 
 
391 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  33.86 
 
 
403 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  33.77 
 
 
403 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  38.36 
 
 
412 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  33.82 
 
 
412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  34.22 
 
 
399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  36.76 
 
 
399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  33.42 
 
 
426 aa  196  4.0000000000000005e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  32.79 
 
 
395 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  36.9 
 
 
398 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  32.31 
 
 
411 aa  193  5e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  35.26 
 
 
401 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  34.55 
 
 
377 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  35.23 
 
 
402 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  37.84 
 
 
414 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  32.93 
 
 
421 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  37.34 
 
 
414 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  35.91 
 
 
425 aa  189  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  30.71 
 
 
396 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  34.33 
 
 
385 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  33.81 
 
 
410 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  34.54 
 
 
397 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  35.16 
 
 
395 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  34.19 
 
 
394 aa  180  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  31.14 
 
 
396 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  32.72 
 
 
447 aa  177  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  32.04 
 
 
404 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  28.61 
 
 
422 aa  176  8e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
420 aa  176  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  33.85 
 
 
444 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  35.16 
 
 
395 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  37.38 
 
 
395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  33.17 
 
 
412 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  33.58 
 
 
400 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  34.3 
 
 
386 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  33.17 
 
 
384 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  31.35 
 
 
506 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  35.56 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  34.13 
 
 
382 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  34.22 
 
 
402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  35.64 
 
 
406 aa  166  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  31.13 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  31.27 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  33.05 
 
 
387 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  32.08 
 
 
400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  33.59 
 
 
404 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  32.81 
 
 
398 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  35.93 
 
 
399 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  33.45 
 
 
382 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  30.05 
 
 
404 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  34.31 
 
 
407 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  33.43 
 
 
373 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
382 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.4 
 
 
422 aa  159  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  32.21 
 
 
386 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  33.25 
 
 
389 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  31.9 
 
 
391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  31.9 
 
 
391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  30.65 
 
 
404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  29.71 
 
 
383 aa  156  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  31.73 
 
 
390 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  30.73 
 
 
405 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  30.79 
 
 
711 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  30.93 
 
 
378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  30.35 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  31.63 
 
 
384 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  33.33 
 
 
395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  29.48 
 
 
401 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  31.55 
 
 
385 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  30.72 
 
 
385 aa  149  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  29.24 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  30.95 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  30.95 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  31.98 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  33.96 
 
 
373 aa  147  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>