More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5237 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  100 
 
 		 399 aa  776    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  65.33 
 
 		 398 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  65.66 
 
 		 400 aa  498  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  64.32 
 
 		 400 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  63.84 
 
 		 404 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  64.3 
 
 		 412 aa  463  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  61.5 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  45 
 
 		 412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  45.18 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  41.25 
 
 		 395 aa  246  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  40.45 
 
 		 397 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  41.25 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  40.76 
 
 		 389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  39.14 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  38.69 
 
 		 396 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  41.25 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  42.78 
 
 		 400 aa  229  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  39.51 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  38.69 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  38.32 
 
 		 384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  44.56 
 
 		 406 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  35.89 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  38.48 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  35.64 
 
 		 401 aa  208  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  33.42 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  41.63 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  39.06 
 
 		 397 aa  205  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  40.95 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  37.07 
 
 		 397 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  37.2 
 
 		 401 aa  202  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  41.9 
 
 		 407 aa  202  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  34.99 
 
 		 402 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  35.77 
 
 		 403 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  34.38 
 
 		 402 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  39.1 
 
 		 425 aa  199  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  34.84 
 
 		 402 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  34.4 
 
 		 402 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  33.42 
 
 		 397 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  34.84 
 
 		 402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  32.9 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  35.37 
 
 		 402 aa  197  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  37.83 
 
 		 398 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  32.64 
 
 		 397 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  32.64 
 
 		 397 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  32.64 
 
 		 397 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  35.51 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  33.16 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  32.38 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  40.15 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  33.07 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  38.4 
 
 		 421 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  39.73 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  37.82 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  37.18 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  36.01 
 
 		 377 aa  186  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  38.24 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  35.51 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  37.13 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  33.16 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  33.24 
 
 		 401 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  39.06 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  37.57 
 
 		 389 aa  179  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  36.76 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  32.09 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  37.63 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  36.91 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  37.87 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  36.76 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  37.63 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  32.98 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  34.6 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  36.07 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  34.68 
 
 		 404 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  36.31 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  33.92 
 
 		 422 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  37.64 
 
 		 387 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  33.33 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  36.41 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  36.73 
 
 		 430 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  37.69 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  33.42 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  35.47 
 
 		 416 aa  166  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  33.92 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 420 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.96 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  34.67 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.96 
 
 		 411 aa  157  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  33.25 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  30.94 
 
 		 711 aa  153  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.42 
 
 		 447 aa  153  5.9999999999999996e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  35.52 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  31.89 
 
 		 427 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  30.42 
 
 		 413 aa  149  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  35.34 
 
 		 381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  31.48 
 
 		 506 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04576  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01950)  30.54 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.669089  normal  0.45987 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  31.27 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  33 
 
 		 421 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  30.7 
 
 		 382 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  29.89 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>