More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1110 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 389 aa  773    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  54.07 
 
 		 384 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  54.07 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  41.5 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  41.67 
 
 		 401 aa  256  5e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  36.63 
 
 		 422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  41.41 
 
 		 401 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  40.91 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  39.7 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  40.4 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  40.2 
 
 		 400 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2548  salicylate hydroxylase  52.11 
 
 		 221 aa  224  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  40.25 
 
 		 412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  40.76 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  40.1 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  37.47 
 
 		 397 aa  206  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  37.18 
 
 		 395 aa  196  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  33 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  37.53 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  39.18 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  39.6 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  37.06 
 
 		 412 aa  190  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  38.6 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  37.47 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  34.66 
 
 		 401 aa  188  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  36.73 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  37.95 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  34.67 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  38.52 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  37.69 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  33.42 
 
 		 395 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  33.16 
 
 		 396 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  39.58 
 
 		 406 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  37.76 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  34.93 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  33.85 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  33.33 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  35.19 
 
 		 385 aa  166  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  33.86 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  33.77 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  32.63 
 
 		 402 aa  162  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  33.51 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  32.89 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  33.42 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  32.83 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  32.83 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  37.17 
 
 		 407 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  33.83 
 
 		 404 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  33.83 
 
 		 422 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  33.76 
 
 		 444 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  33.07 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  32.8 
 
 		 402 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  32.8 
 
 		 402 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  30.81 
 
 		 397 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  32.53 
 
 		 391 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  30.61 
 
 		 397 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  30.53 
 
 		 386 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  30.61 
 
 		 397 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  30.56 
 
 		 400 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  30.61 
 
 		 397 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  33.24 
 
 		 401 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  30.61 
 
 		 397 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  29.81 
 
 		 396 aa  152  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  31.41 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  30.4 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  30.34 
 
 		 397 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  32.07 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  33.71 
 
 		 385 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  31.38 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  33.59 
 
 		 406 aa  149  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  32.63 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  30.92 
 
 		 711 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  32.81 
 
 		 410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  32.83 
 
 		 404 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  33.15 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  31.44 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  31.83 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  33.33 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  33.33 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  31.55 
 
 		 430 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  31.27 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.57 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  32.01 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  32.64 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  29.41 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  30.93 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  31 
 
 		 382 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.22 
 
 		 414 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  31 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  29.62 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  29.58 
 
 		 416 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  29.69 
 
 		 377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  28.57 
 
 		 385 aa  131  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  28.27 
 
 		 385 aa  131  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  30.46 
 
 		 697 aa  129  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  29.82 
 
 		 378 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  31.58 
 
 		 402 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  31.87 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>