More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0896 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 389 aa  780    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  53.47 
 
 		 391 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  53.47 
 
 		 391 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  52.7 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  52.31 
 
 		 389 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  52.2 
 
 		 384 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  47.29 
 
 		 373 aa  312  5.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  38.58 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  34.99 
 
 		 395 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  35.26 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  35.68 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  36.57 
 
 		 403 aa  205  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  37.56 
 
 		 395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  35.75 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  38.36 
 
 		 395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  37.56 
 
 		 404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  37.82 
 
 		 412 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  38.11 
 
 		 395 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  35.79 
 
 		 400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  36.32 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  35.83 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  37.82 
 
 		 399 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  35.77 
 
 		 400 aa  176  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  37.12 
 
 		 399 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  36.04 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  36.32 
 
 		 397 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  37.86 
 
 		 391 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  35.4 
 
 		 402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  36.24 
 
 		 406 aa  166  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  31.46 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  32.82 
 
 		 384 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  32.73 
 
 		 387 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  31.25 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  31.78 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  37.5 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  31.83 
 
 		 711 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  30.93 
 
 		 389 aa  156  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  31.27 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  35.63 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  34.46 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  32.67 
 
 		 399 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  31.68 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  36.6 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.49 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  31.11 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  33.79 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.37 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  33.04 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  31.44 
 
 		 401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  34.18 
 
 		 386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  32.35 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  31.47 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  30.69 
 
 		 401 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  36.63 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  31.47 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  33.67 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  31.18 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.63 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  34.8 
 
 		 381 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  36.04 
 
 		 407 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  33.88 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  35.35 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  32.08 
 
 		 386 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  32.75 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  32.91 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  32.91 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  32.12 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  31.98 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  32.12 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  33.13 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  32.15 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  31.59 
 
 		 385 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  34.29 
 
 		 378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.6 
 
 		 447 aa  136  6.0000000000000005e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  33.5 
 
 		 444 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0367059 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  31.95 
 
 		 506 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  31.91 
 
 		 430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  31.58 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  31.5 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  32.66 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  31.56 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  32.66 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  32.66 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  32.66 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  32.66 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  31.5 
 
 		 422 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  31.87 
 
 		 416 aa  133  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  31.19 
 
 		 421 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  31.66 
 
 		 404 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  30.32 
 
 		 378 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  28.5 
 
 		 697 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  31.71 
 
 		 397 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  33.87 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  24.46 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  30.43 
 
 		 427 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  31.96 
 
 		 383 aa  125  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  32.49 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  30.34 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.1 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>