More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7505 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
407 aa  773    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  84.83 
 
 
406 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  67.09 
 
 
395 aa  474  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  65.9 
 
 
395 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  65.9 
 
 
395 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  64.19 
 
 
397 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  44.19 
 
 
398 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  45.38 
 
 
399 aa  257  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  44.47 
 
 
400 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  43.32 
 
 
400 aa  250  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  45.69 
 
 
412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  44.9 
 
 
412 aa  243  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  41.58 
 
 
401 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  37.34 
 
 
397 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  45.23 
 
 
400 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  41.41 
 
 
412 aa  230  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  38.76 
 
 
397 aa  230  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  42.86 
 
 
399 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  43.39 
 
 
404 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  41.33 
 
 
398 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  41.56 
 
 
414 aa  222  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  41.82 
 
 
414 aa  222  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  42.71 
 
 
394 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  38.86 
 
 
399 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  36.42 
 
 
395 aa  216  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  39.4 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  40.91 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  37.56 
 
 
396 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  45.48 
 
 
397 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  34.42 
 
 
402 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  37.44 
 
 
408 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  37.4 
 
 
413 aa  209  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  37.2 
 
 
403 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  35.2 
 
 
402 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  39.04 
 
 
402 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  36.9 
 
 
401 aa  205  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  32.61 
 
 
400 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  35.41 
 
 
427 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  33.69 
 
 
397 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  36.64 
 
 
401 aa  203  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  33.69 
 
 
397 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  33.42 
 
 
426 aa  203  5e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  33.69 
 
 
397 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  33.69 
 
 
397 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  38.72 
 
 
389 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  35.23 
 
 
402 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  33.42 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  34.96 
 
 
402 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  31.91 
 
 
397 aa  199  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  32.52 
 
 
400 aa  199  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  38.78 
 
 
430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  34.13 
 
 
402 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  33.08 
 
 
411 aa  196  7e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  34.42 
 
 
402 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  37.18 
 
 
384 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  36.99 
 
 
384 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  36.73 
 
 
391 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  33.8 
 
 
396 aa  189  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  38.29 
 
 
444 aa  189  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  37.82 
 
 
389 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  35.71 
 
 
421 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  33.06 
 
 
404 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  33.78 
 
 
403 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  38.08 
 
 
406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  34.31 
 
 
416 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  35.79 
 
 
377 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  31.48 
 
 
401 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.82 
 
 
414 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  33.1 
 
 
506 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  30.75 
 
 
422 aa  175  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  37.27 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  37.06 
 
 
390 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  37.06 
 
 
391 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  37.06 
 
 
391 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  34.7 
 
 
385 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  34.84 
 
 
421 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 
420 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  30.54 
 
 
413 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  37.68 
 
 
410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  37.08 
 
 
389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  36.9 
 
 
387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  30.48 
 
 
711 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  35.98 
 
 
422 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  35.69 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  33.42 
 
 
404 aa  154  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04576  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01950)  32.66 
 
 
459 aa  153  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.669089  normal  0.45987 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.54 
 
 
447 aa  149  7e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  33.93 
 
 
404 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  32.56 
 
 
402 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  37.04 
 
 
395 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08200  conserved hypothetical protein  32.99 
 
 
448 aa  146  5e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54635  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  35.04 
 
 
373 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  33.52 
 
 
386 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  32.68 
 
 
386 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  34.65 
 
 
404 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  34.71 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  34.99 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  34.99 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  32.03 
 
 
697 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  32.3 
 
 
385 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>