More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2160 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
395 aa  769    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  87.09 
 
 
395 aa  664    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  86.84 
 
 
395 aa  646    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  64.21 
 
 
397 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  66.67 
 
 
407 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  67.2 
 
 
406 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  42.11 
 
 
400 aa  262  8.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  43.07 
 
 
400 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  43.88 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  41.85 
 
 
398 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  41.4 
 
 
412 aa  243  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  41.96 
 
 
412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  41.25 
 
 
399 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  44.13 
 
 
412 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  37.7 
 
 
397 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  41.79 
 
 
404 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  37.09 
 
 
397 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  37.4 
 
 
399 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  39.49 
 
 
414 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  38.74 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  39.49 
 
 
414 aa  217  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  40.31 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  40.43 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  37.36 
 
 
395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  34.15 
 
 
402 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  37.28 
 
 
425 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  34.04 
 
 
397 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  32.25 
 
 
400 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  32.89 
 
 
397 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  32.89 
 
 
397 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  37.43 
 
 
427 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  32.89 
 
 
397 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  32.89 
 
 
397 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  32.63 
 
 
397 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  32.97 
 
 
400 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  37.18 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  34.61 
 
 
408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  38.08 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  36.75 
 
 
396 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  39.37 
 
 
403 aa  199  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  36.48 
 
 
401 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  40.85 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  34.04 
 
 
402 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  36.22 
 
 
401 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  35.05 
 
 
403 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  37.71 
 
 
402 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  33.78 
 
 
402 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  37.22 
 
 
373 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  33.88 
 
 
402 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  33.88 
 
 
402 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  33.6 
 
 
402 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  33.66 
 
 
422 aa  187  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  34.69 
 
 
404 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  38.17 
 
 
389 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  37.56 
 
 
389 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  32.05 
 
 
401 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  33.99 
 
 
426 aa  186  4e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  34.48 
 
 
413 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  32.57 
 
 
411 aa  186  7e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  36.03 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  37.36 
 
 
391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  35.7 
 
 
406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  37.31 
 
 
430 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  36.36 
 
 
384 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  35.59 
 
 
444 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  37.22 
 
 
390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  36.41 
 
 
391 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  36.41 
 
 
391 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  35.18 
 
 
384 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  33.06 
 
 
396 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  34.02 
 
 
421 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  36.25 
 
 
384 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  35.36 
 
 
416 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  35.31 
 
 
387 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  29.76 
 
 
413 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  36.67 
 
 
422 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  36.39 
 
 
404 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.98 
 
 
414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  36.77 
 
 
404 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  36.21 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  34.35 
 
 
377 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  32.35 
 
 
506 aa  163  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  37.8 
 
 
395 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  38.68 
 
 
420 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  33.75 
 
 
404 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  34.56 
 
 
373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  34.2 
 
 
421 aa  152  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  32.85 
 
 
402 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08200  conserved hypothetical protein  31.03 
 
 
448 aa  146  6e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54635  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  34.2 
 
 
405 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  32.98 
 
 
697 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
410 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  34.72 
 
 
386 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  29.2 
 
 
711 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  33.72 
 
 
381 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  32.44 
 
 
385 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04576  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01950)  31.14 
 
 
459 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.669089  normal  0.45987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  32.39 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.27 
 
 
447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  33.88 
 
 
385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>