More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1193 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 390 aa  779    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  96.41 
 
 		 391 aa  735    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  96.41 
 
 		 391 aa  735    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  57.03 
 
 		 389 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  54.26 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  52.7 
 
 		 389 aa  362  4e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  52.76 
 
 		 384 aa  342  7e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  40.05 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  35.43 
 
 		 395 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  36.18 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  35.62 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  36.49 
 
 		 400 aa  202  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  35.64 
 
 		 412 aa  189  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  37.53 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  36.91 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  35.93 
 
 		 400 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  36.5 
 
 		 406 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  36.52 
 
 		 412 aa  176  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  38.73 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  37.22 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  36.16 
 
 		 404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  36.81 
 
 		 397 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  31.67 
 
 		 413 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  36.12 
 
 		 402 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  32.23 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  35.26 
 
 		 399 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  33.5 
 
 		 384 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  32.15 
 
 		 385 aa  162  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  34.17 
 
 		 389 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  36.96 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  33.16 
 
 		 421 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  30.91 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  33.16 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  32.93 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  34.79 
 
 		 413 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  37.22 
 
 		 395 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  33.15 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  34.44 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  34.81 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  34.44 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  33.23 
 
 		 385 aa  149  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  31.76 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  34.14 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  37.17 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.6 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  30.4 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  33.24 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  31.5 
 
 		 397 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  31.5 
 
 		 397 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  31.5 
 
 		 397 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  38.19 
 
 		 397 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  31.5 
 
 		 397 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  29.92 
 
 		 401 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  31.22 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  30.5 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  31.1 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  29.76 
 
 		 382 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  31.23 
 
 		 387 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  29.76 
 
 		 382 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  30.95 
 
 		 400 aa  142  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  32.01 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  30.65 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  34.37 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  30.45 
 
 		 711 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  31.59 
 
 		 373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  31.05 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  34.04 
 
 		 401 aa  139  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  29.49 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  33.8 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  33.08 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  36.34 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  29.81 
 
 		 402 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  29.76 
 
 		 404 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  32.68 
 
 		 408 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  31.07 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04576  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01950)  31.23 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.669089  normal  0.45987 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  30.71 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  29.3 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  32.37 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  34.55 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  30.71 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  29.3 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  29.66 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  30.06 
 
 		 385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  29.44 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.3 
 
 		 422 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  30.81 
 
 		 385 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  28.18 
 
 		 404 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  31.99 
 
 		 371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  27.18 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  27.57 
 
 		 386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.39 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  30.57 
 
 		 506 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  30.11 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  29.36 
 
 		 427 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 		 394 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  32.18 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  29.11 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>