More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0546 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 373 aa  735    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  54.64 
 
 		 391 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  54.64 
 
 		 391 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  54.26 
 
 		 390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  48.04 
 
 		 389 aa  306  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  47.29 
 
 		 389 aa  296  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  50.27 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  38.97 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  41.35 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  38.06 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  41.85 
 
 		 412 aa  209  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  41.19 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  39.35 
 
 		 398 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  39.71 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  41.28 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  33.42 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  40.45 
 
 		 404 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  38.89 
 
 		 400 aa  192  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  40.31 
 
 		 397 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  37.22 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  32.42 
 
 		 413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  40.89 
 
 		 406 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  38.52 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  38.75 
 
 		 385 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  35.1 
 
 		 377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  39.2 
 
 		 397 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  37.8 
 
 		 384 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  37.22 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  37.37 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  37.56 
 
 		 399 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  36.12 
 
 		 412 aa  173  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  37.34 
 
 		 406 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  37.24 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  37.97 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  40.67 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  37.72 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  36.89 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  37.3 
 
 		 430 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  35.19 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  30.25 
 
 		 404 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  35.91 
 
 		 412 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  34.89 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  35.59 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  34.59 
 
 		 401 aa  149  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  34.59 
 
 		 401 aa  149  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  35.88 
 
 		 381 aa  149  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  33.94 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  32.02 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  31.53 
 
 		 422 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  32.64 
 
 		 421 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  32.64 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  31.77 
 
 		 404 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  31.92 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  33.23 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  33.07 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  32.63 
 
 		 397 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  32.85 
 
 		 413 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  32.8 
 
 		 397 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  32.8 
 
 		 397 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  32.8 
 
 		 397 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  33.99 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  32.8 
 
 		 397 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  32.17 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  29.68 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  32.57 
 
 		 711 aa  136  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  33.42 
 
 		 427 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  31.57 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  31.69 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  31.88 
 
 		 382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  36.46 
 
 		 394 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  31.01 
 
 		 396 aa  132  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  30.62 
 
 		 402 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  30.83 
 
 		 400 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  33.69 
 
 		 401 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  29.39 
 
 		 426 aa  132  9e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.23 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  31.82 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  32.29 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  31.2 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  27.18 
 
 		 422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  32.76 
 
 		 425 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  30.85 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  31.92 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  29.36 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  34.2 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04576  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01950)  30.95 
 
 		 459 aa  126  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.669089  normal  0.45987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  32.11 
 
 		 383 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  33.94 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.97 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  31.47 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  32.56 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  30.21 
 
 		 397 aa  123  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  31.1 
 
 		 376 aa  123  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  29.17 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08200  conserved hypothetical protein  30.6 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54635  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  33.43 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  28.99 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  30.88 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  29.66 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>