More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5073 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  100 
 
 
386 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  45.71 
 
 
385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  44.95 
 
 
386 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  46.01 
 
 
385 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  46.01 
 
 
385 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  45.74 
 
 
385 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  47.08 
 
 
402 aa  316  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  45.22 
 
 
385 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  44.94 
 
 
385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  44.09 
 
 
382 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  43.32 
 
 
377 aa  299  7e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  44.09 
 
 
382 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  43.83 
 
 
382 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  41.65 
 
 
383 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  46 
 
 
373 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  43.57 
 
 
382 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  44.93 
 
 
387 aa  292  7e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  41.26 
 
 
378 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  42.09 
 
 
396 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  43.68 
 
 
381 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  41.39 
 
 
397 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  39.94 
 
 
403 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  38.71 
 
 
421 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  38.82 
 
 
406 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  34.91 
 
 
391 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  35.97 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  39.88 
 
 
420 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  34.67 
 
 
410 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  34.01 
 
 
395 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  34.54 
 
 
404 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  37.01 
 
 
399 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  38.62 
 
 
395 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  34.38 
 
 
404 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  35.13 
 
 
422 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  35.13 
 
 
404 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  36.21 
 
 
412 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  33.72 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  36.56 
 
 
397 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  36.86 
 
 
400 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  32.16 
 
 
405 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  31.54 
 
 
413 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  33.52 
 
 
391 aa  169  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  33.52 
 
 
391 aa  169  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  33.33 
 
 
426 aa  168  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  34.07 
 
 
400 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  34.53 
 
 
400 aa  168  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  34.23 
 
 
401 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  34.03 
 
 
402 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  32.96 
 
 
390 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  34.11 
 
 
416 aa  167  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  34.03 
 
 
402 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  35.14 
 
 
389 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  34.21 
 
 
402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  35.91 
 
 
412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  32.87 
 
 
398 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  33.72 
 
 
411 aa  162  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  33.74 
 
 
402 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  32.61 
 
 
398 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  33.74 
 
 
402 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  33.93 
 
 
402 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  33.44 
 
 
404 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  33.62 
 
 
427 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  33.06 
 
 
404 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  34.17 
 
 
373 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  31.42 
 
 
427 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  30.15 
 
 
384 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  35.06 
 
 
395 aa  156  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  31.8 
 
 
400 aa  155  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  31.2 
 
 
401 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08200  conserved hypothetical protein  30.39 
 
 
448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54635  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  32.59 
 
 
412 aa  154  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  32.65 
 
 
421 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  31.56 
 
 
397 aa  153  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.61 
 
 
414 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
430 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  32.61 
 
 
711 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  30.4 
 
 
384 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  36.06 
 
 
399 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  31.76 
 
 
397 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  31.76 
 
 
397 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  31.76 
 
 
397 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  31.49 
 
 
399 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.88 
 
 
447 aa  149  8e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  31.86 
 
 
397 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  33.8 
 
 
395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  31.47 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  31.5 
 
 
400 aa  145  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  33.8 
 
 
309 aa  145  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  32.82 
 
 
403 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  32.21 
 
 
397 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  29.92 
 
 
448 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04576  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01950)  29.95 
 
 
459 aa  143  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.669089  normal  0.45987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  32.47 
 
 
394 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  30.68 
 
 
413 aa  144  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  34.97 
 
 
395 aa  143  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  27.86 
 
 
377 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  32.05 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03392  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17670)  30.21 
 
 
710 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.39217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  29.22 
 
 
376 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  33.24 
 
 
388 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>