More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1067 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
414 aa  807    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  99.52 
 
 
414 aa  804    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  67.33 
 
 
412 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  66.43 
 
 
402 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  62.9 
 
 
444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  60.66 
 
 
425 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  58.27 
 
 
401 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  60 
 
 
398 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  51.26 
 
 
394 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  38.27 
 
 
397 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  39.95 
 
 
395 aa  227  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  40.2 
 
 
395 aa  223  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  40.2 
 
 
395 aa  223  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  41.52 
 
 
397 aa  223  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  42.09 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  38.59 
 
 
400 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  35.97 
 
 
408 aa  210  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  39.28 
 
 
412 aa  209  7e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  34.81 
 
 
400 aa  207  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  37.47 
 
 
412 aa  200  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  35.42 
 
 
402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  34.46 
 
 
401 aa  199  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  35.9 
 
 
427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  34.11 
 
 
400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  34.22 
 
 
401 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  38.61 
 
 
400 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  35.99 
 
 
403 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  41.82 
 
 
407 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  35.12 
 
 
402 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  40.05 
 
 
406 aa  193  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  35.92 
 
 
399 aa  192  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  33.08 
 
 
397 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  33.08 
 
 
397 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  35.39 
 
 
402 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  33.08 
 
 
397 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  33.08 
 
 
397 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  37.75 
 
 
416 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  33.08 
 
 
397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  35.85 
 
 
398 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  34.55 
 
 
396 aa  190  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  35.15 
 
 
402 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  35.15 
 
 
402 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  35.17 
 
 
396 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  32.82 
 
 
397 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  34.96 
 
 
402 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  36.81 
 
 
413 aa  187  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  36.15 
 
 
421 aa  186  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  39.05 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  33.59 
 
 
395 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  35.11 
 
 
397 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  34.4 
 
 
404 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  37.93 
 
 
430 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  35.37 
 
 
414 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  36.87 
 
 
404 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  37.41 
 
 
399 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  34.56 
 
 
389 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  35.73 
 
 
377 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  34.56 
 
 
401 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  34.08 
 
 
386 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  34.25 
 
 
384 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  36.47 
 
 
397 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  35.48 
 
 
421 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  33.97 
 
 
403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  34.16 
 
 
384 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  34.71 
 
 
382 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  32.23 
 
 
385 aa  160  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
382 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  33.16 
 
 
385 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  33.61 
 
 
383 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  31.28 
 
 
385 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 
382 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  26.84 
 
 
422 aa  156  7e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  32.55 
 
 
385 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  33.33 
 
 
382 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  33.89 
 
 
378 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  34.83 
 
 
402 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  32.11 
 
 
385 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  37.09 
 
 
385 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  32.11 
 
 
385 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  34.01 
 
 
391 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  35.06 
 
 
406 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  35.89 
 
 
387 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  31 
 
 
711 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 
420 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  29.28 
 
 
413 aa  139  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  33.15 
 
 
386 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  34.23 
 
 
373 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.13 
 
 
447 aa  137  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  32.91 
 
 
389 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  37.12 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.62 
 
 
426 aa  137  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  29.84 
 
 
411 aa  136  6.0000000000000005e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04576  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01950)  29.06 
 
 
459 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.669089  normal  0.45987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  35.57 
 
 
381 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  29.35 
 
 
506 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  32.85 
 
 
404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  32.86 
 
 
391 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  32.86 
 
 
391 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  34.1 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  31.27 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>