More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0813 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
377 aa  773    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  58.45 
 
 
387 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  59.15 
 
 
402 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  57.02 
 
 
373 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  56.7 
 
 
381 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  43.32 
 
 
386 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  41.78 
 
 
382 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  41.24 
 
 
382 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  40.58 
 
 
382 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  39.52 
 
 
382 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  37.1 
 
 
386 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  37.64 
 
 
383 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  40.23 
 
 
397 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  36.26 
 
 
385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  36.93 
 
 
378 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  36.9 
 
 
385 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  36.9 
 
 
385 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  38.59 
 
 
396 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  37.89 
 
 
403 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  36.63 
 
 
385 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  36.08 
 
 
385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  35.8 
 
 
385 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  35.53 
 
 
385 aa  203  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  37.64 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  35.52 
 
 
421 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  34.72 
 
 
391 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  34.1 
 
 
395 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  33.14 
 
 
404 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  34.72 
 
 
400 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  32.36 
 
 
410 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  33.78 
 
 
395 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  37.05 
 
 
406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  31.32 
 
 
404 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  35.1 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  35.01 
 
 
398 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  35.75 
 
 
389 aa  179  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  34.88 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  34.03 
 
 
416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  29.64 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  31.32 
 
 
404 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  36.64 
 
 
412 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  29.38 
 
 
422 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  35.69 
 
 
412 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  33.99 
 
 
391 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  33.99 
 
 
391 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  35.42 
 
 
404 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  33.43 
 
 
390 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  35.46 
 
 
399 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  35.17 
 
 
402 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  30.86 
 
 
405 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 
420 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  33.04 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  33.53 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  33.33 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  33.53 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  33.53 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  33.53 
 
 
397 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  34.73 
 
 
402 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  33.53 
 
 
384 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  35.33 
 
 
402 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  35.33 
 
 
402 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  30.67 
 
 
399 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  34.02 
 
 
402 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  31.93 
 
 
447 aa  160  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  34.43 
 
 
400 aa  159  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  33.13 
 
 
397 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  32.84 
 
 
427 aa  159  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  30.83 
 
 
421 aa  158  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  33.13 
 
 
400 aa  158  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  33.43 
 
 
402 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  32.25 
 
 
401 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  30.5 
 
 
427 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.9 
 
 
411 aa  157  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  34.83 
 
 
414 aa  157  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  34.83 
 
 
414 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  32.75 
 
 
430 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  34.2 
 
 
395 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.9 
 
 
426 aa  154  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  30.51 
 
 
697 aa  153  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  31.4 
 
 
413 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  34.69 
 
 
399 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  32.3 
 
 
390 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  33.14 
 
 
388 aa  152  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  32.23 
 
 
400 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  33.43 
 
 
404 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.35 
 
 
414 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  33.72 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  31.91 
 
 
421 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  33.24 
 
 
397 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  32.66 
 
 
394 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 
384 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  33.15 
 
 
444 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  30.86 
 
 
396 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  32.42 
 
 
378 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  34.07 
 
 
395 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  30.83 
 
 
364 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  32.15 
 
 
401 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  33.33 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  29.29 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  29.29 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>