More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2257 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  772    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  37.07 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  36.54 
 
 		 377 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  36.44 
 
 		 377 aa  259  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  36.54 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  37.83 
 
 		 374 aa  252  6e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  38.13 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  37.07 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  37.07 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  37.99 
 
 		 367 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  36.05 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  35.32 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  34.49 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  32.72 
 
 		 382 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  33.51 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  33.24 
 
 		 388 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  33.51 
 
 		 409 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  33.78 
 
 		 388 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  34.36 
 
 		 384 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  31.84 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  34.2 
 
 		 377 aa  166  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  34.46 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  34.46 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  35.23 
 
 		 371 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  34.81 
 
 		 392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  30.03 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 425 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  28.82 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  29.07 
 
 		 410 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 		 376 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  33.8 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  31.49 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  30 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  33.23 
 
 		 420 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2455  putative monooxygenase (putative secreted protein)  29.3 
 
 		 393 aa  149  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  28.5 
 
 		 384 aa  149  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  28.8 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  28.8 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0392  monooxygenase FAD-binding protein  32.8 
 
 		 383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.890611  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  28.57 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  28.53 
 
 		 389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  29.49 
 
 		 382 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  31.09 
 
 		 408 aa  145  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1561  monooxygenase FAD-binding  32.74 
 
 		 392 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0688558  normal  0.0725424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  32.42 
 
 		 377 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  31.71 
 
 		 372 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.51 
 
 		 378 aa  143  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  31.85 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  27.7 
 
 		 397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19150  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.23 
 
 		 351 aa  135  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0319604  normal  0.370849 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  30.08 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  33.16 
 
 		 401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.27 
 
 		 404 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  31.56 
 
 		 379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  28.9 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  29.28 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  29.51 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  30.14 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  30.31 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  29.34 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  31.71 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  28.36 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  29.13 
 
 		 376 aa  125  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  28.07 
 
 		 364 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  28.07 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2514  monooxygenase FAD-binding protein  29.46 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  29.06 
 
 		 362 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  29.68 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  29.2 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  28.46 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5646  hypothetical protein  27.25 
 
 		 407 aa  123  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  30.17 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  28.83 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  26.93 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  28.62 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  27.42 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  28.86 
 
 		 421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  30.03 
 
 		 382 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  27.42 
 
 		 422 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  30.92 
 
 		 378 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  29.94 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.99 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  30.47 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  29.63 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  31.19 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  29.24 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  29.75 
 
 		 382 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  27.38 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  29.71 
 
 		 387 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  29.94 
 
 		 402 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  30.65 
 
 		 417 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  30.7 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  28.84 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  28.53 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  30.34 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  30.07 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  30.07 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  31.94 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  30.89 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>