More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4378 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
420 aa  847    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  52.99 
 
 
396 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  53.2 
 
 
392 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  53.69 
 
 
392 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  53.69 
 
 
392 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  39.44 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  34.3 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  34.28 
 
 
382 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  32.04 
 
 
385 aa  155  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  31.08 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  32.21 
 
 
376 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  32.21 
 
 
376 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  31.41 
 
 
395 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  30.79 
 
 
397 aa  146  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  30.23 
 
 
392 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  30.46 
 
 
377 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  31.56 
 
 
390 aa  136  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  31.4 
 
 
384 aa  135  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  33.15 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  29.29 
 
 
377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  31.41 
 
 
377 aa  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  34.49 
 
 
388 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  33.99 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  34.31 
 
 
389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  34.31 
 
 
389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  26.33 
 
 
374 aa  129  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  30.61 
 
 
388 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  29.22 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  33.14 
 
 
389 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  29.89 
 
 
388 aa  127  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.05 
 
 
407 aa  126  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  32.58 
 
 
393 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.47 
 
 
378 aa  124  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  29.03 
 
 
364 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  29.03 
 
 
360 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  29.97 
 
 
377 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  29.33 
 
 
364 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  28.77 
 
 
388 aa  120  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  27.25 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  32.44 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  27.25 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  27.35 
 
 
401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  29.89 
 
 
397 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  33.63 
 
 
384 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  34.78 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  31.09 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  30.55 
 
 
404 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.81 
 
 
422 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  30.57 
 
 
385 aa  112  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  31.44 
 
 
392 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  29.2 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  32.65 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  31.96 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  28.94 
 
 
384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  31.99 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  30.81 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  31.99 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  29.77 
 
 
404 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  30.11 
 
 
408 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  31.56 
 
 
399 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  28.71 
 
 
404 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  29.2 
 
 
388 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  29.94 
 
 
367 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  29.86 
 
 
391 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  29.94 
 
 
390 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  29.48 
 
 
382 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 
384 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  28.68 
 
 
404 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08521  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06050)  27.83 
 
 
469 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.883838  normal  0.0891916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  29.75 
 
 
382 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  30.93 
 
 
402 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  29.48 
 
 
382 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  29.38 
 
 
386 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  30.29 
 
 
410 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  28.92 
 
 
385 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  30.84 
 
 
416 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  28.92 
 
 
385 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  28.92 
 
 
385 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 
378 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1561  monooxygenase FAD-binding  33.23 
 
 
392 aa  103  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0688558  normal  0.0725424 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  25.71 
 
 
403 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  30.94 
 
 
374 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  32.4 
 
 
402 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 
371 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  31.18 
 
 
408 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  29.18 
 
 
382 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  28.01 
 
 
385 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  30.09 
 
 
413 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  29.58 
 
 
408 aa  100  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2455  putative monooxygenase (putative secreted protein)  28.49 
 
 
393 aa  100  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  28.5 
 
 
421 aa  99.8  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  31.68 
 
 
389 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  30.16 
 
 
420 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  29 
 
 
405 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  28.11 
 
 
421 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  26.46 
 
 
557 aa  97.1  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  26.27 
 
 
383 aa  96.7  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19150  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.67 
 
 
351 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0319604  normal  0.370849 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  31.23 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>